More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0237 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
569 aa  1139    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.92 
 
 
579 aa  642    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.14 
 
 
579 aa  654    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  41.57 
 
 
605 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  41.4 
 
 
566 aa  437  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  42.43 
 
 
624 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.71 
 
 
595 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  41.83 
 
 
614 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  41.07 
 
 
616 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  41.27 
 
 
616 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  39.09 
 
 
600 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  40.84 
 
 
617 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.44 
 
 
616 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  35.33 
 
 
589 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 
604 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.35 
 
 
614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.5 
 
 
597 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  41.94 
 
 
609 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.24 
 
 
609 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.26 
 
 
597 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.62 
 
 
597 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.44 
 
 
607 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.4 
 
 
629 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  39.13 
 
 
601 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.16 
 
 
610 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.52 
 
 
623 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.95 
 
 
621 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 
632 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.26 
 
 
621 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.16 
 
 
610 aa  382  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.76 
 
 
622 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.12 
 
 
628 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.35 
 
 
623 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.11 
 
 
635 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.15 
 
 
620 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.61 
 
 
577 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.38 
 
 
584 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.24 
 
 
609 aa  364  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.62 
 
 
600 aa  363  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.49 
 
 
626 aa  363  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.6 
 
 
608 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.9 
 
 
612 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.08 
 
 
606 aa  349  9e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.25 
 
 
630 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  35.67 
 
 
592 aa  335  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  32.01 
 
 
556 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  32.14 
 
 
542 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.16 
 
 
567 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  29.33 
 
 
562 aa  228  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  29.09 
 
 
545 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.13 
 
 
575 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.07 
 
 
541 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.86 
 
 
541 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.86 
 
 
541 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.86 
 
 
541 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  28.52 
 
 
550 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.98 
 
 
566 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.65 
 
 
555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.12 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  28.82 
 
 
551 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30.39 
 
 
541 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.32 
 
 
541 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  30.39 
 
 
541 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.6 
 
 
544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  29.84 
 
 
545 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  29.54 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.18 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  29.77 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  27.73 
 
 
542 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.67 
 
 
560 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.67 
 
 
560 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.33 
 
 
560 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  29.77 
 
 
541 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  35.38 
 
 
562 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.42 
 
 
563 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.12 
 
 
560 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  27.9 
 
 
541 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  28.75 
 
 
543 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  35.39 
 
 
559 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.8 
 
 
560 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  29.49 
 
 
528 aa  211  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.67 
 
 
541 aa  211  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  31.85 
 
 
552 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.36 
 
 
554 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.76 
 
 
581 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.27 
 
 
555 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  37.86 
 
 
542 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  27.89 
 
 
542 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  31.34 
 
 
545 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.65 
 
 
554 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  31.2 
 
 
536 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  29.65 
 
 
547 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  28 
 
 
548 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  28 
 
 
548 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.22 
 
 
548 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  28 
 
 
548 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  29.35 
 
 
557 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.78 
 
 
548 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.55 
 
 
541 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  28 
 
 
548 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>