More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0086 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 501 aa  991    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  55.91 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  55.53 
 
 		 508 aa  521  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.98 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.86 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  41.01 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  41.12 
 
 		 533 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  41.43 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42 
 
 		 853 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.37 
 
 		 856 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  41.1 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.79 
 
 		 848 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.99 
 
 		 849 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.19 
 
 		 856 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  43.6 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.27 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.35 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  37.85 
 
 		 554 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.67 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  41.6 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36.67 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  36.48 
 
 		 554 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 		 554 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.21 
 
 		 531 aa  359  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  35.91 
 
 		 554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.2 
 
 		 839 aa  355  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  39.31 
 
 		 843 aa  353  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  36.65 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  36.65 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  37.66 
 
 		 532 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  35.26 
 
 		 531 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  37.74 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  37.55 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  36.89 
 
 		 537 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  35.31 
 
 		 532 aa  336  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  38.61 
 
 		 533 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  37.24 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.55 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.36 
 
 		 845 aa  335  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.58 
 
 		 834 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.16 
 
 		 844 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.43 
 
 		 844 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  38.36 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  38.76 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  38.36 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.11 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.67 
 
 		 530 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.74 
 
 		 533 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.54 
 
 		 533 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.56 
 
 		 533 aa  317  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38 
 
 		 844 aa  316  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  35.6 
 
 		 551 aa  316  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  36.01 
 
 		 532 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.65 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.65 
 
 		 531 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  35.23 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.6 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.15 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  37.87 
 
 		 625 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  36.44 
 
 		 512 aa  299  8e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  35.42 
 
 		 534 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.24 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  36.44 
 
 		 621 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  37.32 
 
 		 681 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 532 aa  296  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  36.49 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 616 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  36.95 
 
 		 529 aa  290  3e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  36.86 
 
 		 621 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 		 632 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  36.38 
 
 		 629 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  37.16 
 
 		 626 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 		 632 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  36.38 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2645  preprotein translocase subunit SecD  36.86 
 
 		 616 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00285631  hitchhiker  0.000483823 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14630  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 620 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  34.58 
 
 		 632 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  43.47 
 
 		 399 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1292  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 620 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  34.54 
 
 		 614 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  37.1 
 
 		 622 aa  283  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  35.78 
 
 		 521 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0979  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 603 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0701  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 687 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  33.73 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0878  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 620 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16793 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  35.86 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0835  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 620 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707354  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2845  preprotein translocase subunit SecD  34.08 
 
 		 604 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  37.47 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  39.46 
 
 		 503 aa  279  8e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3992  preprotein translocase subunit SecD  36.19 
 
 		 695 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.725975  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 616 aa  279  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1230  preprotein translocase subunit SecD  35.47 
 
 		 622 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.888537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  35.62 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4343  preprotein translocase subunit SecD  36.19 
 
 		 620 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150095  hitchhiker  0.0000000819724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>