More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0066 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
151 aa  309  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  63.64 
 
 
149 aa  177  5.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  58.94 
 
 
152 aa  175  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  54.73 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 
155 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 
160 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  59.85 
 
 
155 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 
160 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  52.7 
 
 
158 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  52.7 
 
 
158 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 
155 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  59.85 
 
 
161 aa  156  8e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  58.78 
 
 
161 aa  156  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
158 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
158 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  59.54 
 
 
160 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
158 aa  155  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  60.31 
 
 
159 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  59.54 
 
 
164 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
161 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  58.78 
 
 
164 aa  154  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 
158 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  59.54 
 
 
160 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 
158 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 
165 aa  153  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  59.54 
 
 
160 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
158 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  57.58 
 
 
162 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 
163 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 
160 aa  149  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
180 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  56.06 
 
 
165 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 
188 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  50.33 
 
 
161 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  50.33 
 
 
161 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 
159 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  55.73 
 
 
166 aa  148  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 
162 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50.33 
 
 
159 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  49.67 
 
 
161 aa  147  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 
161 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  53.52 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  56.45 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  45.95 
 
 
157 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  137  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  135  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  50.77 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  133  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  52.8 
 
 
129 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  52.8 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.4 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>