162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0058 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0163  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  67.16 
 
 
169 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  59.7 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  61.19 
 
 
177 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  62.69 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  59.7 
 
 
179 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  61.19 
 
 
193 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  59.7 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  59.7 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  59.7 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  59.7 
 
 
180 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
155 aa  81.6  3e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  56.72 
 
 
231 aa  82  3e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  56.34 
 
 
208 aa  81.6  3e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
252 aa  81.3  4e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
227 aa  80.9  5e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  56.72 
 
 
187 aa  80.5  8e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  55.22 
 
 
229 aa  79.7  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  56.72 
 
 
165 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  56.72 
 
 
160 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
195 aa  79  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  55.22 
 
 
172 aa  79.3  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
206 aa  79.3  2e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
166 aa  79  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  55.22 
 
 
250 aa  79  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
173 aa  78.6  3e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  55.22 
 
 
165 aa  78.6  3e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
757 aa  78.6  3e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
118 aa  78.2  4e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
121 aa  77.8  4e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
150 aa  77.8  4e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
266 aa  77.8  5e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  59.7 
 
 
168 aa  77.8  5e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
125 aa  76.6  9e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3031  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
142 aa  76.6  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.532106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
144 aa  76.6  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
196 aa  76.6  1e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
113 aa  75.5  2e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
241 aa  75.1  3e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
167 aa  74.7  4e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  41.24 
 
 
109 aa  74.3  5e-13  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
118 aa  74.3  5e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
118 aa  74.3  5e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
126 aa  73.9  7e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  44 
 
 
126 aa  73.9  7e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
136 aa  73.9  7e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
118 aa  73.9  7e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 
118 aa  73.9  7e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
118 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  43.24 
 
 
118 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
118 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  41.89 
 
 
118 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 
118 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.34436e-06  hitchhiker  7.49265e-09 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
118 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
118 aa  73.2  1e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  38.38 
 
 
118 aa  72  2e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
272 aa  72  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
282 aa  72.8  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
129 aa  72  2e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 
281 aa  71.6  3e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  48.57 
 
 
116 aa  71.6  3e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.04332e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 
142 aa  70.9  5e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
142 aa  70.9  5e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
117 aa  70.5  7e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  38.38 
 
 
118 aa  70.5  7e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  47.76 
 
 
245 aa  70.5  8e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  44.16 
 
 
118 aa  70.1  9e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 
112 aa  70.1  9e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
130 aa  69.7  1e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
121 aa  69.7  1e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
140 aa  69.7  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
121 aa  69.3  2e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
162 aa  68.9  2e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
120 aa  68.9  2e-11  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 
126 aa  68.6  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 
118 aa  68.6  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
159 aa  68.2  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  40.54 
 
 
118 aa  68.2  3e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  33 
 
 
125 aa  68.2  3e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
120 aa  68.6  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
143 aa  67.8  4e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  40.7 
 
 
159 aa  67.8  5e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
137 aa  67.8  5e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
149 aa  67.8  5e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
141 aa  67.8  5e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.81748e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
144 aa  67.4  7e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
118 aa  67.4  7e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 
143 aa  67  7e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 
143 aa  67  7e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
116 aa  67  8e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 
141 aa  67  8e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
137 aa  67  9e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  40.85 
 
 
146 aa  66.2  1e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
134 aa  66.6  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
134 aa  66.2  1e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
134 aa  66.2  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
137 aa  66.6  1e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
126 aa  66.2  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 
137 aa  66.2  1e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>