More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0038 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  100 
 
 
420 aa  852  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  36.32 
 
 
443 aa  320  4e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.41 
 
 
446 aa  319  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  39.12 
 
 
436 aa  312  6e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  37.2 
 
 
450 aa  305  1e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  38.88 
 
 
449 aa  303  3e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  40.14 
 
 
446 aa  303  3e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  38.28 
 
 
450 aa  303  4e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  38.39 
 
 
449 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  37.9 
 
 
444 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  37.65 
 
 
450 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  37.65 
 
 
450 aa  298  9e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  37.64 
 
 
441 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  37.68 
 
 
441 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  36.41 
 
 
443 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  35.73 
 
 
435 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  35.46 
 
 
443 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  36.32 
 
 
435 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  35.22 
 
 
443 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  37.56 
 
 
444 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  37.56 
 
 
444 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  35.43 
 
 
435 aa  285  1e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  37.32 
 
 
444 aa  284  2e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  39.53 
 
 
448 aa  284  2e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  38.18 
 
 
462 aa  283  5e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  35.58 
 
 
439 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  36.65 
 
 
462 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  34.43 
 
 
442 aa  279  8e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  37.37 
 
 
445 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.43 
 
 
442 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.72 
 
 
442 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  36.91 
 
 
454 aa  260  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  34.9 
 
 
439 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.66 
 
 
446 aa  256  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.08 
 
 
446 aa  255  1e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.08 
 
 
446 aa  255  1e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  33.01 
 
 
469 aa  254  2e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  2.01302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  32.58 
 
 
453 aa  253  5e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  36.55 
 
 
461 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  37.08 
 
 
451 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  34.76 
 
 
461 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.09 
 
 
445 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.05 
 
 
450 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.51 
 
 
428 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.37 
 
 
428 aa  182  9e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.28 
 
 
432 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.14 
 
 
435 aa  180  3e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  27.7 
 
 
434 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 
429 aa  172  7e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.0948e-15  normal 
 
 
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.98 
 
 
407 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.82 
 
 
443 aa  169  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.66 
 
 
427 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  27.23 
 
 
457 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.54 
 
 
415 aa  167  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.34 
 
 
430 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  26.96 
 
 
422 aa  166  1e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.96 
 
 
422 aa  166  1e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  26.65 
 
 
426 aa  164  2e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.3 
 
 
427 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.25 
 
 
444 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.57607e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.1 
 
 
436 aa  163  4e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.82 
 
 
407 aa  163  5e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  25.19 
 
 
421 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  26 
 
 
441 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.83 
 
 
437 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.83 
 
 
440 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  29.06 
 
 
419 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  29.06 
 
 
419 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  26.85 
 
 
442 aa  157  5e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.55 
 
 
432 aa  156  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.36659e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.02 
 
 
432 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  26.79 
 
 
446 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27.27 
 
 
403 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  24.71 
 
 
425 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.58 
 
 
435 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.01957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.35 
 
 
429 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  29.44 
 
 
442 aa  154  3e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.08344e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  26.23 
 
 
428 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  25.98 
 
 
425 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.13 
 
 
442 aa  152  9e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  27.36 
 
 
442 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  26.27 
 
 
451 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  24.12 
 
 
436 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  29.25 
 
 
442 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.86682e-08  hitchhiker  1.62747e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  29.25 
 
 
442 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.49314e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  24.48 
 
 
421 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  29.25 
 
 
442 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.78843e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  24.8 
 
 
441 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  29.25 
 
 
442 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.14613e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  28.13 
 
 
440 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.66572e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  27.43 
 
 
437 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.06 
 
 
439 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  27.11 
 
 
433 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  27.11 
 
 
433 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  27.79 
 
 
463 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  27.43 
 
 
442 aa  149  1e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.37237e-05  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  25 
 
 
443 aa  149  1e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27.43 
 
 
442 aa  149  1e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.71266e-07  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  27.43 
 
 
442 aa  149  1e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.51795e-08  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  27.74 
 
 
431 aa  149  1e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>