46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_R0037 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_R0037    100 
 
 		 384 bp  761    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    86.23 
 
 		 384 bp  321  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    83.29 
 
 		 384 bp  216  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0060    90.75 
 
 		 377 bp  208  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0042    88.95 
 
 		 376 bp  190  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133373  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0027    88.37 
 
 		 378 bp  182  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0032    88.37 
 
 		 376 bp  182  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.550963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0036    92.22 
 
 		 356 bp  123  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    92.05 
 
 		 384 bp  119  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0039    95.24 
 
 		 358 bp  67.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972065  hitchhiker  3.4201500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0014    95.24 
 
 		 356 bp  67.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00683811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01123    92.31 
 
 		 367 bp  54  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2839    96.67 
 
 		 362 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2840    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3023    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0263643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3862    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.896825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0072    96.67 
 
 		 380 bp  52  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2891    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2910    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2909    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0323379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07640    96.67 
 
 		 371 bp  52  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.755411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4975    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0450462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0065    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2226    100 
 
 		 360 bp  52  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0026    96.67 
 
 		 362 bp  52  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5057  10Sa RNA (tmRNA)  96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4764    96.67 
 
 		 363 bp  52  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000108878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  52  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0030    96.67 
 
 		 362 bp  52  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.462293  normal  0.749063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0016    96.55 
 
 		 384 bp  50.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000497382  normal  0.186928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0039    96.55 
 
 		 362 bp  50.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    96.55 
 
 		 362 bp  50.1  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0569  sRNA  96.55 
 
 		 375 bp  50.1  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0033    96.55 
 
 		 354 bp  50.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0023    96.55 
 
 		 371 bp  50.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000931822  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0007    91.67 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0023    91.67 
 
 		 367 bp  48.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0045    91.67 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0067    91.67 
 
 		 357 bp  48.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  0.0116195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0008    91.67 
 
 		 357 bp  48.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0008    100 
 
 		 340 bp  46.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1411  AftmRNA  100 
 
 		 364 bp  46.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0023    100 
 
 		 363 bp  46.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  93.55 
 
 		 365 bp  46.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0064    100 
 
 		 363 bp  46.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_MctmRNA1  sRNA  100 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>