35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5024 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 
327 aa  640  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7531  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.65 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  normal  0.0598355 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  25.98 
 
 
333 aa  85.5  1e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.07 
 
 
304 aa  82  1e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08210  conjugal transfer protein TraA  27.14 
 
 
316 aa  79.3  8e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.89 
 
 
298 aa  78.6  1e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.4 
 
 
291 aa  78.2  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7349  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.72 
 
 
332 aa  74.3  3e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.149767 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.24 
 
 
310 aa  71.2  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.23 
 
 
298 aa  71.6  2e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.13 
 
 
350 aa  65.1  1e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.97 
 
 
336 aa  57.8  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  24.03 
 
 
384 aa  57.8  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.23 
 
 
385 aa  57  5e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.38 
 
 
345 aa  54.3  3e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.64 
 
 
386 aa  53.9  4e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.11 
 
 
365 aa  53.5  5e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  23.88 
 
 
328 aa  53.1  6e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0038  putative conjugal transfer protein  21.88 
 
 
350 aa  50.8  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.27 
 
 
1444 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  23.94 
 
 
1468 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.51 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  32.5 
 
 
1169 aa  47.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.16 
 
 
314 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0451  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  28.23 
 
 
385 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  25.79 
 
 
389 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  34.51 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  26.05 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  26.05 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.43 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  28.21 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0176  hypothetical protein  28.09 
 
 
1562 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  26.29 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  26.29 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6210  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.81 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.427299  normal  0.125195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>