147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5021 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 450 aa  913    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  46.22 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  44.44 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  43.98 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  33.04 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  42.03 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  43.06 
 
 		 453 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  42.18 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  41.71 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  37.01 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  40.65 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  40.85 
 
 		 372 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  41.28 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  29.4 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  41.06 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  37.71 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  38.02 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  39.72 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  41.15 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  36.41 
 
 		 396 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  40.55 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  40 
 
 		 380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  39.73 
 
 		 410 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  40.62 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  33.44 
 
 		 391 aa  147  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  44.1 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  41.41 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  36.04 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  37.44 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  37.32 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  37.32 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  40.41 
 
 		 492 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.56 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  35.23 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  35.32 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  34.72 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  32.64 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.33 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  37.31 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  31.75 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  34.45 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  38.19 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  30.95 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  35.08 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  32.94 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  34.03 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  34.43 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  28.78 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  35.82 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  29.2 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.67 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  34.41 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  34.41 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  34.88 
 
 		 445 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  32.28 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  34.21 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  30.9 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  30.9 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  33.69 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  32.63 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  31.75 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  32.18 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  30.14 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  30.9 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  31.18 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  34.03 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  33.33 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  34.52 
 
 		 410 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  32.81 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  30.65 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  29.8 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  32.12 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  31.55 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  34.03 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  34.39 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  30.69 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  31.28 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  31.09 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  34.69 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  35.2 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  32.04 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  32.62 
 
 		 400 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  30.46 
 
 		 431 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  35.71 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  31.09 
 
 		 375 aa  97.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  29.53 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  29.53 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  35.94 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  34.87 
 
 		 425 aa  96.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  34.54 
 
 		 427 aa  96.7  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  29.15 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  33.68 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  30.11 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  31.49 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  29.78 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  31.15 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  29.02 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  34.18 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  33.51 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  34.39 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>