More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4956 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4956  porin  100 
 
 
347 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  36.28 
 
 
338 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.31 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  32.8 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.1 
 
 
356 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.67 
 
 
359 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  30.42 
 
 
356 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30.42 
 
 
356 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  31.46 
 
 
327 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  28.24 
 
 
376 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.1 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.12 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  27.76 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  28.57 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.68 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  29.78 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  29.01 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  30.79 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.55 
 
 
351 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  30.91 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.13 
 
 
374 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  32.7 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  30.56 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  28.44 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  29.11 
 
 
354 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  32.13 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  30.36 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  31.51 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  28.91 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  29.46 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  29.46 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  27.94 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  31.64 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  29.02 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  30.29 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  28.3 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  32.52 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  29.46 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  28.11 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  29.63 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  30.48 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.02 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  29.37 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  32.45 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  29.65 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.07 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  29.43 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  29.45 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  29.44 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  26.11 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  28.48 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5937  porin  29.1 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  32.29 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  29.52 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  29.52 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1717  OmpC family outer membrane porin  30.59 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  32.12 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  31.76 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  28.45 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  28.5 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  27.5 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  29.81 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  29.21 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  29.27 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  31.51 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  28.94 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  32.89 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  32.89 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  28.23 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  27.67 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  29.56 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  31.46 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  30.25 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  30.08 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  37.65 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  27.84 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  31.5 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  28.79 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  30.25 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  28.48 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  29.74 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  28.5 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  28.5 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  31.5 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  27.25 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  27.88 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  27.51 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  29.25 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  34.78 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  29.14 
 
 
426 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.5 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.22 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  34.16 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  28.22 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.15 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  31.96 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>