More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4883 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  79.57 
 
 		 237 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  81.82 
 
 		 238 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  81.82 
 
 		 238 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  74.46 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  71.12 
 
 		 235 aa  341  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  70.26 
 
 		 237 aa  341  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  70.56 
 
 		 237 aa  335  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  70.69 
 
 		 236 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  71.82 
 
 		 237 aa  331  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  67.24 
 
 		 236 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  55.35 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  55.19 
 
 		 307 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  55.35 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 454 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 568 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  52.78 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  52.09 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  52.31 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  51.85 
 
 		 281 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  51.61 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  51.15 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  51.15 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  51.15 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  50.23 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  50.46 
 
 		 310 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  49.32 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.77 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  52.13 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  52.2 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  48.61 
 
 		 302 aa  201  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 		 296 aa  201  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  49.3 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  48.84 
 
 		 326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  49.04 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  47 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 		 410 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  46.92 
 
 		 405 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  46.45 
 
 		 410 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 		 398 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 		 398 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 		 404 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.39 
 
 		 404 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.25 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  48.85 
 
 		 419 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 		 413 aa  176  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 		 410 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.82 
 
 		 404 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  44.49 
 
 		 327 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 372 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.87 
 
 		 405 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 411 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  45.12 
 
 		 400 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.67 
 
 		 322 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.43 
 
 		 418 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 405 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  47.87 
 
 		 404 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  47.87 
 
 		 405 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  48.34 
 
 		 415 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 		 438 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.34 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  47.39 
 
 		 418 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  47.87 
 
 		 404 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  48.1 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  41.43 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 		 412 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  48.1 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  48.1 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  43.3 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  46.45 
 
 		 429 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  43.33 
 
 		 298 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  46.45 
 
 		 404 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.3 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 		 322 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>