More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4721 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
492 aa  1008    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
496 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  40.12 
 
 
476 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
501 aa  329  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  40.28 
 
 
509 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
509 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
509 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.05 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.4 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
470 aa  309  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.79 
 
 
508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.74 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.28 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.52 
 
 
517 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.28 
 
 
485 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
485 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  37.77 
 
 
476 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.14 
 
 
485 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.22 
 
 
481 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
494 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
485 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
487 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  38.51 
 
 
509 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.61 
 
 
507 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 
520 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
494 aa  293  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.02 
 
 
504 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.8 
 
 
489 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  37.2 
 
 
478 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
492 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36.02 
 
 
520 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.16 
 
 
503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  38.24 
 
 
516 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.24 
 
 
503 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.28 
 
 
473 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.61 
 
 
500 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
495 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
516 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.03 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
490 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  37.98 
 
 
502 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
569 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
494 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
494 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  37.37 
 
 
494 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.82 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  37.37 
 
 
495 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  36.2 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.61 
 
 
502 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
502 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 
515 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
475 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
488 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  36.49 
 
 
488 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
496 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
488 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
511 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
498 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
503 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  37.6 
 
 
502 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
493 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.24 
 
 
497 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
513 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  38.76 
 
 
481 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
492 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
502 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
502 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
502 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
505 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  37.81 
 
 
502 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 
509 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  38.04 
 
 
492 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
492 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
475 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  36.55 
 
 
498 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.55 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.81 
 
 
523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  38.09 
 
 
488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
564 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36.16 
 
 
561 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
546 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
564 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 
506 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
499 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.42 
 
 
485 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  37.74 
 
 
501 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>