More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4644 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4644  porin  100 
 
 		 387 aa  780    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  63.46 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  57.46 
 
 		 400 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  60.11 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  53.96 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  45.73 
 
 		 426 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  43.58 
 
 		 431 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  44.55 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  42.58 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  41.71 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  42.13 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  41.07 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  39.9 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  40.36 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  39.4 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  40.97 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  39.18 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  37.53 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  38.78 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  35.27 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  38.19 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  36.24 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.67 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  35.55 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  33.24 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  36.36 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  34.28 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  31.96 
 
 		 358 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.44 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  33.8 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  32.96 
 
 		 335 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  31.65 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  31.39 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.17 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.02 
 
 		 352 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.79 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.79 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.79 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.12 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.52 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.52 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.52 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.14 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.2 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  30.73 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.64 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30.86 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.62 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.79 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  28.38 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.24 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.24 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  28.54 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  29.58 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.16 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  30.19 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.59 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  30.18 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  30.18 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.73 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  29.77 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  30.08 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  29.3 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  30.5 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  31.78 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  31.06 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  42.48 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.03 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.03 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  32.54 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.28 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.28 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.54 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.78 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.33 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.33 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  30.13 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.03 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  47.9 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  30.94 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  29.71 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  31.1 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  30.77 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  28.75 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  29.71 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  29.38 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  31.5 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.25 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  29.72 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.66 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  29.33 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.14 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  29.08 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.03 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  29.33 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  29.62 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  29.62 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.37 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>