261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4551 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  680    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  82.19 
 
 
321 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  75.47 
 
 
319 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  76.49 
 
 
321 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  72.05 
 
 
319 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  73.6 
 
 
318 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  66.46 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  61.01 
 
 
319 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  60.82 
 
 
317 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  61.83 
 
 
319 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  61.01 
 
 
319 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  61.32 
 
 
319 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  61.32 
 
 
319 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  59.31 
 
 
319 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  59.06 
 
 
339 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  59.31 
 
 
319 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  59.12 
 
 
319 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  59.43 
 
 
319 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  59.31 
 
 
319 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  58.75 
 
 
339 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  58.75 
 
 
336 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  58.68 
 
 
319 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  57.7 
 
 
335 aa  384  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  57.7 
 
 
335 aa  384  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  57.86 
 
 
319 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  54.72 
 
 
318 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  53.46 
 
 
316 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  52.98 
 
 
317 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  52.83 
 
 
316 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  54.1 
 
 
329 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  53.14 
 
 
317 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  50.62 
 
 
318 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  50.94 
 
 
316 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  49.21 
 
 
316 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  49.37 
 
 
316 aa  328  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  60.94 
 
 
264 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  48.3 
 
 
321 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  50.15 
 
 
320 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.52 
 
 
319 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  47.04 
 
 
319 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  47.68 
 
 
319 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  48.91 
 
 
320 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  45.15 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.02 
 
 
298 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
299 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
312 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 
323 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 
333 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
332 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
321 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.02 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 
342 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.88 
 
 
318 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 
318 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.31 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.15 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 
292 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
319 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  29.39 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
312 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 
304 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 
438 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  69.39 
 
 
49 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  25.97 
 
 
637 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  25.19 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.57 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.71 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  27.2 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  24.9 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  26.54 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.53 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>