More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4520 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
477 aa  961    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
482 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
476 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  55.08 
 
 
477 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  55.51 
 
 
477 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.03 
 
 
476 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  54.03 
 
 
475 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  55.6 
 
 
478 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 
478 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.39 
 
 
475 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.74 
 
 
478 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  55.27 
 
 
485 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  55.27 
 
 
495 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  53.6 
 
 
477 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
477 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  53.8 
 
 
477 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
477 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.39 
 
 
475 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
481 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  51.89 
 
 
505 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  51.68 
 
 
481 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.27 
 
 
481 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  51.27 
 
 
477 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.27 
 
 
481 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
482 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 
477 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.12 
 
 
476 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.27 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
485 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
481 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  50.11 
 
 
480 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.53 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.63 
 
 
481 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50 
 
 
481 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.63 
 
 
480 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
479 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  51.47 
 
 
480 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  51.48 
 
 
478 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
493 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
477 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  49.15 
 
 
477 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
477 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  51.69 
 
 
478 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
476 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
496 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
487 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  47.13 
 
 
477 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
478 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.18 
 
 
482 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  43.01 
 
 
476 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.18 
 
 
482 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.76 
 
 
482 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.18 
 
 
483 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.18 
 
 
482 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.97 
 
 
482 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.33 
 
 
482 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
482 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.54 
 
 
482 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
489 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.97 
 
 
480 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.33 
 
 
482 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.33 
 
 
482 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
483 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
489 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.33 
 
 
482 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  41.33 
 
 
482 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  44.84 
 
 
476 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.45 
 
 
482 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.45 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.24 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
489 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
489 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
489 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.16 
 
 
483 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
489 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
485 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
489 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.81 
 
 
482 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.81 
 
 
482 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
489 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
483 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  43.78 
 
 
483 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.95 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.25 
 
 
491 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
493 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
489 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
484 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
482 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>