More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4493 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 577 aa  1190    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1968  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 518 aa  276  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  35.07 
 
 		 503 aa  269  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 533 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 509 aa  133  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 527 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.2 
 
 		 504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.77 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 516 aa  124  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 530 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.48 
 
 		 532 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 		 513 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 509 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.88 
 
 		 517 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 515 aa  120  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.41 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 		 527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.74 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.32 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.32 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 528 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.74 
 
 		 524 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 524 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.78 
 
 		 535 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  26.94 
 
 		 502 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 		 535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 530 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  27.36 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 514 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 518 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 501 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  24.82 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.86 
 
 		 535 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 516 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 		 523 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.68 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.68 
 
 		 525 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 520 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  22.34 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 534 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 495 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6464  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.9 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  25.65 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.3 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.3 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 508 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.3 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 506 aa  107  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4029  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 502 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>