201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4485 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  77.31 
 
 
265 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  78.16 
 
 
265 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  78.16 
 
 
300 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  71.27 
 
 
268 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  71.91 
 
 
274 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  71.26 
 
 
263 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  72.76 
 
 
268 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  72.98 
 
 
274 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  55.17 
 
 
278 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  55.17 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  57.26 
 
 
274 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.49 
 
 
269 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  50.95 
 
 
285 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  51.33 
 
 
289 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  50.19 
 
 
257 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  53.94 
 
 
266 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  54.73 
 
 
284 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  51.87 
 
 
281 aa  247  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  46.74 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  47.41 
 
 
274 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  47.41 
 
 
274 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  47.41 
 
 
274 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  47.41 
 
 
274 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  48.39 
 
 
295 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  47.92 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  47.92 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  44.23 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  47.5 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  45.45 
 
 
285 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.86 
 
 
286 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
280 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  47.52 
 
 
274 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
274 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
274 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
274 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
313 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
313 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  46.86 
 
 
274 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  46.03 
 
 
286 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  40.17 
 
 
261 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  40.77 
 
 
286 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.84 
 
 
279 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  39.37 
 
 
339 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  39.37 
 
 
339 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  35.74 
 
 
254 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  38.98 
 
 
339 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  41.23 
 
 
254 aa  174  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  35.86 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  38.58 
 
 
339 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  36.1 
 
 
252 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  39.91 
 
 
341 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  39.91 
 
 
341 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  35.39 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  38.55 
 
 
337 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.15 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  37.86 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  37.66 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  38.2 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  36.21 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  35.54 
 
 
268 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  37.92 
 
 
330 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37 
 
 
253 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  37 
 
 
253 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  37.14 
 
 
268 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  37 
 
 
253 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  37 
 
 
253 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  37.83 
 
 
254 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.34 
 
 
273 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  37.61 
 
 
253 aa  158  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  36.56 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  34.85 
 
 
282 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  37.39 
 
 
338 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  36.56 
 
 
282 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  36.56 
 
 
282 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  36.56 
 
 
282 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  37.16 
 
 
252 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.61 
 
 
243 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  36.32 
 
 
243 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  36.32 
 
 
243 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  36.32 
 
 
243 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  36.55 
 
 
251 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.55 
 
 
261 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.84 
 
 
243 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  33.47 
 
 
257 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  33.86 
 
 
293 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.78 
 
 
245 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.39 
 
 
244 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.56 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  34.69 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.71 
 
 
289 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.9 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.9 
 
 
245 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>