More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4441 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  775    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  64.77 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  49.32 
 
 
322 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.18 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.05 
 
 
339 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.33 
 
 
324 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.72 
 
 
344 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.83 
 
 
345 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.83 
 
 
345 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.05 
 
 
328 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.16 
 
 
336 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.62 
 
 
330 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.62 
 
 
330 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.23 
 
 
333 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.16 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.53 
 
 
324 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.69 
 
 
360 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.01 
 
 
339 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.33 
 
 
335 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.64 
 
 
331 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.48 
 
 
328 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.97 
 
 
326 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.36 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.39 
 
 
328 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 
328 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.13 
 
 
344 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.94 
 
 
331 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.54 
 
 
330 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.34 
 
 
335 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.92 
 
 
324 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.04 
 
 
358 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.46 
 
 
327 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  39.95 
 
 
330 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  38.42 
 
 
324 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.22 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  37.63 
 
 
330 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.24 
 
 
322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.43 
 
 
339 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.77 
 
 
325 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.27 
 
 
351 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.62 
 
 
323 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.36 
 
 
325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  37.29 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.78 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.78 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.56 
 
 
341 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.78 
 
 
322 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.11 
 
 
326 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  34.83 
 
 
335 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.11 
 
 
349 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  38.84 
 
 
335 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.8 
 
 
337 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.78 
 
 
318 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  36.39 
 
 
331 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  37.96 
 
 
330 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  37.96 
 
 
330 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.02 
 
 
325 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.07 
 
 
328 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.07 
 
 
328 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.49 
 
 
322 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 
332 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  37.1 
 
 
335 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.93 
 
 
325 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.22 
 
 
348 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.07 
 
 
325 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.47 
 
 
318 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.66 
 
 
325 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  36.91 
 
 
326 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.64 
 
 
337 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.19 
 
 
327 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  39.49 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.66 
 
 
334 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.78 
 
 
339 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.86 
 
 
356 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.19 
 
 
322 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.26 
 
 
333 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.85 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.48 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.29 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  38.14 
 
 
317 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.08 
 
 
328 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  36.24 
 
 
334 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.01 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  34.85 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 
314 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  37.85 
 
 
317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  38.59 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  34.94 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  35.56 
 
 
324 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.21 
 
 
336 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  33.61 
 
 
339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.64 
 
 
322 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.84 
 
 
349 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.19 
 
 
331 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  39.49 
 
 
386 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.6 
 
 
324 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.69 
 
 
327 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 
326 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  36.08 
 
 
326 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>