More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4436 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4436  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
352 aa  711  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00650478  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4102  LysR family transcriptional regulator  84.59 
 
 
312 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4743  LysR family transcriptional regulator  82.84 
 
 
334 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3454  transcriptional regulator, LysR family  82.57 
 
 
314 aa  515  1e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1579  transcriptional regulator, LysR family  72.2 
 
 
315 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4285  LysR family transcriptional regulator  76.62 
 
 
312 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4038  LysR family transcriptional regulator  68.39 
 
 
331 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3728  LysR family transcriptional regulator  67.18 
 
 
348 aa  452  1e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4202  LysR family transcriptional regulator  69.68 
 
 
324 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0903744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4295  LysR family transcriptional regulator  67.18 
 
 
345 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1659  LysR family transcriptional regulator  70.33 
 
 
316 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1095  LysR family transcriptional regulator  69.64 
 
 
316 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0374  LysR family transcriptional regulator  67.83 
 
 
317 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0495  LysR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
316 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1008  LysR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
316 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0155  LysR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
316 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150061  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1455  LysR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
316 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1381  LysR family transcriptional regulator  69.31 
 
 
316 aa  440  1e-122  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.727507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2317  LysR family regulatory protein  69.49 
 
 
302 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1699  LysR family transcriptional regulator  66.25 
 
 
341 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761604  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4054  LysR family transcriptional regulator  68.75 
 
 
316 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3205  LysR family transcriptional regulator  68.75 
 
 
316 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241885  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4312  LysR family transcriptional regulator  69.2 
 
 
299 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0608  LysR family transcriptional regulator  62.83 
 
 
309 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6019  LysR family transcriptional regulator  59.49 
 
 
322 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1124  LysR family transcriptional regulator  41.42 
 
 
318 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0684  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
306 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  7.43111e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3696  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
305 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0640  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
305 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148889  hitchhiker  0.000410503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3663  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
302 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0773  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 
306 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0635  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
305 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  2.10235e-08  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0595  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
305 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.872616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4568  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
305 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00026007  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0677  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.8 
 
 
306 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0035  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
312 aa  217  3e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6363  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 
304 aa  214  2e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284625  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5706  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
298 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0443967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0209  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 
305 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.150203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0100  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
306 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01640  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
305 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262408  normal  0.919946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1630  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
296 aa  201  1e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.48911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1540  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
334 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2851  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
321 aa  197  2e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4053  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.88 
 
 
311 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49590  transcriptional regulator  37.46 
 
 
300 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224866  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6273  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.38 
 
 
301 aa  185  1e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3519  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 
315 aa  182  8e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1040  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 
306 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0665507  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0380  transcriptional regulator  36.07 
 
 
316 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03780  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 
320 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3439  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
306 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0785  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
304 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352567  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0638  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.327526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4643  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
303 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
305 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2155  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  175  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3437  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
304 aa  174  1e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1997  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0675  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2242  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  175  1e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1596  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2149  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 
298 aa  174  1e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.463348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5172  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
303 aa  174  2e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4985  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
305 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2060  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
309 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
297 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3084  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
305 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5283  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
305 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770818  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3917  transcriptional regulator  35.76 
 
 
297 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46060  transcriptional regulator  35.76 
 
 
297 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.89621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0637  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
304 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1458  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
297 aa  165  1e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3104  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 
308 aa  164  2e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459931  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1389  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
297 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4522  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
297 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3930  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
314 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4028  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
297 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  0.0962956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1799  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
299 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0309251  normal  0.330495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2782  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
341 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3814  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
297 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5195  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
306 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4666  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
307 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3864  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
306 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.163001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5120  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
297 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3174  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
320 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1618  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
305 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0301028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1887  transcriptional regulator of LysR family protein  26.87 
 
 
308 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  0.0439695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2197  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 
309 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2574  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
320 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.475396  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4378  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
305 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2553  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 
302 aa  134  2e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.36259  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4054  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4499  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
303 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1551  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
306 aa  127  4e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1818  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
296 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3543  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
318 aa  119  8e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1724  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 
313 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2194  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
296 aa  113  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0690526  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4516  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
302 aa  111  2e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>