34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4431 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  42.26 
 
 
4428 aa  1396    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  100 
 
 
2796 aa  5420    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  75.82 
 
 
3340 aa  3674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  41.47 
 
 
1641 aa  621  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  49.34 
 
 
860 aa  292  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  40.59 
 
 
1099 aa  286  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  47.23 
 
 
756 aa  273  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  47.76 
 
 
768 aa  271  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  47.85 
 
 
790 aa  268  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  48.83 
 
 
764 aa  264  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  45.91 
 
 
1196 aa  259  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  48.69 
 
 
777 aa  259  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  46.67 
 
 
3864 aa  254  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  46.04 
 
 
4830 aa  248  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  45.82 
 
 
7434 aa  246  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  44.28 
 
 
768 aa  245  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  38.26 
 
 
770 aa  243  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  46.55 
 
 
873 aa  239  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  45.14 
 
 
781 aa  233  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  45 
 
 
819 aa  233  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  46.59 
 
 
889 aa  229  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  46.82 
 
 
763 aa  212  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  43.09 
 
 
465 aa  211  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  51.58 
 
 
954 aa  183  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  46.67 
 
 
479 aa  161  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  54.05 
 
 
145 aa  150  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  33.04 
 
 
918 aa  89  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  28.36 
 
 
3923 aa  74.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  37.81 
 
 
846 aa  69.3  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  26.68 
 
 
2886 aa  69.7  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  46.46 
 
 
1526 aa  59.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  29.01 
 
 
8064 aa  56.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.97 
 
 
5451 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  24.8 
 
 
4697 aa  49.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>