193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4399 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
727 aa  1469  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 
627 aa  314  4e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
828 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
717 aa  276  1e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
717 aa  273  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.35 
 
 
589 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
789 aa  272  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  34.92 
 
 
699 aa  270  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
776 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
821 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 
828 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
776 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 
828 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
821 aa  264  5e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
776 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
776 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
776 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.51 
 
 
589 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
708 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
626 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
1106 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
732 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 
723 aa  256  1e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
790 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 
824 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.84 
 
 
781 aa  250  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.44 
 
 
1106 aa  250  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  34.24 
 
 
585 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
619 aa  246  1e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 
790 aa  246  1e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
789 aa  246  2e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
633 aa  245  2e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
833 aa  244  4e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.8 
 
 
1221 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.77 
 
 
937 aa  243  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
1714 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
598 aa  241  3e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
754 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
595 aa  240  6e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
833 aa  240  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.23 
 
 
708 aa  237  5e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 
529 aa  236  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.63 
 
 
797 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
968 aa  236  1e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 
754 aa  235  2e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  35.62 
 
 
596 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
796 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
779 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
718 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
734 aa  231  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
780 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.48 
 
 
780 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 
667 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
1143 aa  221  4e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.2 
 
 
740 aa  221  4e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 
822 aa  220  8e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  36.27 
 
 
921 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
974 aa  217  6e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.95 
 
 
739 aa  215  3e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.87 
 
 
1116 aa  214  4e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.75 
 
 
1415 aa  214  4e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
647 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
733 aa  211  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
693 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  30.64 
 
 
553 aa  207  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  37.16 
 
 
552 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
713 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
633 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.64 
 
 
1144 aa  203  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.51 
 
 
739 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
654 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.61 
 
 
739 aa  193  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 
715 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
909 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.81 
 
 
742 aa  184  4e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.51 
 
 
816 aa  184  5e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
750 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.6 
 
 
793 aa  182  3e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
706 aa  181  5e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
740 aa  180  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
667 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
660 aa  177  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
700 aa  176  1e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1085 aa  175  2e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 
569 aa  175  2e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
761 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
632 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
3560 aa  170  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  32.22 
 
 
560 aa  170  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  31.73 
 
 
680 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
647 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
4489 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
616 aa  167  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
3035 aa  164  4e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
611 aa  164  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
808 aa  163  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
750 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
574 aa  161  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
672 aa  160  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
1094 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>