52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4344 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  68.56 
 
 
777 aa  709  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  64.27 
 
 
770 aa  657  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  65.24 
 
 
768 aa  659  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  100 
 
 
846 aa  1727  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  57.5 
 
 
764 aa  558  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  48.48 
 
 
790 aa  471  1e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  47.04 
 
 
763 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  63.37 
 
 
918 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  45.42 
 
 
4830 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  61.71 
 
 
1196 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  45.87 
 
 
3864 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  46.44 
 
 
889 aa  328  2e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  48.19 
 
 
954 aa  323  1e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  41.32 
 
 
781 aa  319  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  45.19 
 
 
768 aa  313  8e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  42.88 
 
 
873 aa  308  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  41.56 
 
 
756 aa  303  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  41.43 
 
 
7434 aa  298  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  40.37 
 
 
819 aa  296  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  44.19 
 
 
860 aa  282  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  67.26 
 
 
465 aa  271  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  53.22 
 
 
308 aa  258  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  61.21 
 
 
479 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.49 
 
 
3066 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.39 
 
 
2156 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  34 
 
 
3340 aa  141  5e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.79 
 
 
1526 aa  134  7e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  37.25 
 
 
4428 aa  121  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.83 
 
 
2768 aa  118  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  30.37 
 
 
5442 aa  114  1e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  34.08 
 
 
1641 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  32.76 
 
 
1099 aa  82.4  3e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4339  hypothetical protein  77.55 
 
 
247 aa  75.9  3e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  32.45 
 
 
4697 aa  74.7  7e-12  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  30.36 
 
 
1699 aa  72.4  3e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  39.29 
 
 
2193 aa  68.9  4e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  42.34 
 
 
2796 aa  68.2  6e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  34.31 
 
 
1827 aa  67.8  9e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  28.47 
 
 
1359 aa  67  1e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  41.03 
 
 
2927 aa  66.2  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  28.25 
 
 
1902 aa  60.8  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.38 
 
 
2839 aa  60.8  1e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  28.47 
 
 
2194 aa  60.5  1e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.3 
 
 
852 aa  57.8  8e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.44 
 
 
4480 aa  57  1e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  28.21 
 
 
2886 aa  52.4  3e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  23.28 
 
 
3146 aa  48.9  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.66 
 
 
1627 aa  48.9  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4285e-06 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  31.11 
 
 
1151 aa  48.5  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  30.17 
 
 
4678 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  35.34 
 
 
1586 aa  47.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  27.78 
 
 
3470 aa  44.3  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>