More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4315 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 297 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  75.52 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  75.52 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  66.67 
 
 		 288 aa  349  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  66.67 
 
 		 288 aa  349  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  73.51 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  73.58 
 
 		 287 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  64.39 
 
 		 288 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  68.29 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  64.55 
 
 		 280 aa  315  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  62.31 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  67.35 
 
 		 294 aa  261  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  54.07 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  54.2 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 268 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  56.34 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 		 268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 268 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  54.1 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 266 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  45.6 
 
 		 264 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  55.56 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 		 267 aa  225  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.13 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  56.02 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 266 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  51.41 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 		 490 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 497 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 264 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  44.57 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 484 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 265 aa  212  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 497 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  48.98 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 		 264 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 268 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 484 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 492 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  47.99 
 
 		 275 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  51.61 
 
 		 271 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 		 271 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  47.56 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 284 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  51.52 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  41.51 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>