More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4279 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  715    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  82.84 
 
 
330 aa  527  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  49.33 
 
 
339 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  49.32 
 
 
335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.63 
 
 
330 aa  295  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.92 
 
 
335 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.15 
 
 
330 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
331 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.2 
 
 
333 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.26 
 
 
336 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.64 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.65 
 
 
328 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.21 
 
 
339 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  44.74 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.69 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.12 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.85 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.74 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.12 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.64 
 
 
331 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.49 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.81 
 
 
328 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.25 
 
 
327 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  44.27 
 
 
332 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.54 
 
 
330 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.54 
 
 
330 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.69 
 
 
326 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.31 
 
 
328 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.18 
 
 
314 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.44 
 
 
334 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.22 
 
 
325 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.97 
 
 
332 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.03 
 
 
331 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.31 
 
 
353 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.26 
 
 
349 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  44.44 
 
 
346 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.72 
 
 
331 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.62 
 
 
332 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.54 
 
 
333 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  44.69 
 
 
329 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.32 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  44.63 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.34 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.52 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.34 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  46.11 
 
 
698 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.32 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.9 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.89 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.14 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.89 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.95 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.05 
 
 
355 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.94 
 
 
337 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  47.28 
 
 
312 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 
328 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.29 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.87 
 
 
358 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.22 
 
 
320 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  47.33 
 
 
330 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 
348 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  42.57 
 
 
325 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  42.57 
 
 
325 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.69 
 
 
337 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  42.62 
 
 
323 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.33 
 
 
335 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.08 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.51 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.67 
 
 
328 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.43 
 
 
327 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.04 
 
 
335 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  42.67 
 
 
328 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.41 
 
 
323 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  43.54 
 
 
335 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  43.94 
 
 
329 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.3 
 
 
323 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  47.06 
 
 
361 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  40.06 
 
 
324 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.12 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.74 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.14 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  44.44 
 
 
327 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.45 
 
 
324 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  42.2 
 
 
333 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  41.99 
 
 
337 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  40.94 
 
 
325 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  43.13 
 
 
344 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.28 
 
 
325 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.15 
 
 
331 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  45.11 
 
 
322 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 
322 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.41 
 
 
330 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  44.22 
 
 
343 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.5 
 
 
330 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.94 
 
 
330 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.96 
 
 
322 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.75 
 
 
327 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  41.64 
 
 
337 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.9 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>