More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4266 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  780    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  44.95 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  42.6 
 
 
388 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  39.85 
 
 
390 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  38.61 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  42.15 
 
 
390 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  42.15 
 
 
386 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.52 
 
 
385 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  37.4 
 
 
383 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  40.33 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  40.26 
 
 
383 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  39.9 
 
 
390 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.36 
 
 
387 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  42.08 
 
 
389 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  39.21 
 
 
385 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  37.47 
 
 
383 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  40.28 
 
 
389 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  40.1 
 
 
393 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  38.12 
 
 
390 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.89 
 
 
388 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  40.9 
 
 
385 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.28 
 
 
385 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  41.42 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  40.63 
 
 
395 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.17 
 
 
384 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  41.29 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  40.63 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  39.71 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  37.67 
 
 
381 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  36.68 
 
 
383 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  39.69 
 
 
389 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  40.63 
 
 
385 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  40.63 
 
 
385 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  36.94 
 
 
383 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  41.05 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  37.77 
 
 
392 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  40 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.47 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.24 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  38.31 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.55 
 
 
385 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  37.05 
 
 
403 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.95 
 
 
402 aa  209  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.91 
 
 
389 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  38.95 
 
 
381 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  35.86 
 
 
390 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.38 
 
 
397 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  39.63 
 
 
389 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.75 
 
 
548 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.09 
 
 
548 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.09 
 
 
550 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.27 
 
 
382 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.09 
 
 
550 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.09 
 
 
550 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  37.53 
 
 
388 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  38.52 
 
 
384 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  37.86 
 
 
389 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  35.34 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  37.6 
 
 
384 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.22 
 
 
396 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.25 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  36.27 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  37.01 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  34.39 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  33.77 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.09 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.32 
 
 
378 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  34.67 
 
 
453 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.81 
 
 
541 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  33.42 
 
 
391 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.46 
 
 
379 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  36.27 
 
 
396 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.72 
 
 
379 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  35.09 
 
 
388 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.82 
 
 
389 aa  176  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  34.46 
 
 
383 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  31.78 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  34.48 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  34.11 
 
 
392 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.64 
 
 
384 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.21 
 
 
391 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  32.99 
 
 
389 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.39 
 
 
397 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.16 
 
 
383 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  33.59 
 
 
383 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  33.84 
 
 
381 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  32.33 
 
 
390 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 
382 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.67 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  32.98 
 
 
379 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  34.21 
 
 
382 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  32.05 
 
 
405 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.86 
 
 
388 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.86 
 
 
388 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.01 
 
 
402 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.4 
 
 
394 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>