98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4235 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  65.32 
 
 
419 aa  231  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  61.63 
 
 
417 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  58.05 
 
 
419 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  57.56 
 
 
418 aa  208  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  40 
 
 
450 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  36.51 
 
 
454 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  31.58 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  31.58 
 
 
377 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.76 
 
 
378 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  29.32 
 
 
378 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  36.14 
 
 
409 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  30 
 
 
369 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  31.82 
 
 
336 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  32.43 
 
 
423 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  30.23 
 
 
370 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  31.43 
 
 
411 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  38.75 
 
 
397 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  26.36 
 
 
412 aa  51.2  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  33.06 
 
 
386 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  30.66 
 
 
365 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  31.71 
 
 
398 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  36 
 
 
416 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  35.29 
 
 
362 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  27.05 
 
 
397 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  36.29 
 
 
394 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  38.27 
 
 
362 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  32 
 
 
424 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  30.43 
 
 
364 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  31.2 
 
 
394 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.97 
 
 
399 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  31.34 
 
 
364 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  33.77 
 
 
409 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  31.82 
 
 
367 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  30.12 
 
 
597 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  26.52 
 
 
378 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  32.69 
 
 
367 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  31.96 
 
 
369 aa  47.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  32.69 
 
 
367 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  25.47 
 
 
347 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  31.15 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  27.66 
 
 
363 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  36.23 
 
 
549 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  29.27 
 
 
399 aa  45.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  27.11 
 
 
416 aa  45.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  27.27 
 
 
357 aa  45.1  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  40.24 
 
 
380 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  34.67 
 
 
388 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  30.91 
 
 
490 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  24 
 
 
459 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  26.05 
 
 
369 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  36.23 
 
 
393 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  24.59 
 
 
376 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28 
 
 
395 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  28.57 
 
 
595 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  32.99 
 
 
430 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  26.24 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  31.51 
 
 
381 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  28.97 
 
 
377 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  30.16 
 
 
628 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  30.77 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  31.71 
 
 
427 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 
365 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  32 
 
 
370 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  32 
 
 
370 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  31.25 
 
 
399 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  27.85 
 
 
486 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  31.47 
 
 
405 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  26.4 
 
 
431 aa  41.6  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  41.6  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  32.52 
 
 
398 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  30.77 
 
 
460 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  31.25 
 
 
399 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  26.81 
 
 
373 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  32.99 
 
 
370 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  30.36 
 
 
515 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  25 
 
 
448 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.48 
 
 
293 aa  41.2  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  34.78 
 
 
386 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  31.51 
 
 
396 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  30.77 
 
 
453 aa  41.6  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25.25 
 
 
642 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  25.81 
 
 
448 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  30.43 
 
 
395 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  30.43 
 
 
395 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>