235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4215 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  65.2 
 
 
207 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  63.18 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.56 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  56.86 
 
 
209 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  54.9 
 
 
207 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  58.91 
 
 
209 aa  232  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  54.41 
 
 
207 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  57 
 
 
205 aa  228  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  54.9 
 
 
206 aa  227  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  52.24 
 
 
208 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  54.95 
 
 
230 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  52.74 
 
 
205 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  55.5 
 
 
202 aa  222  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  54.9 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  55 
 
 
201 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  51.74 
 
 
205 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  52.24 
 
 
207 aa  217  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  53.5 
 
 
201 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  54 
 
 
201 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  53.77 
 
 
209 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  54 
 
 
201 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  51.5 
 
 
207 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  54.5 
 
 
210 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  51.23 
 
 
209 aa  214  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  51.74 
 
 
205 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  51.72 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  47.26 
 
 
218 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  52.97 
 
 
209 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.72 
 
 
209 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  51.23 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  51.23 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  51.23 
 
 
209 aa  210  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  50.24 
 
 
208 aa  210  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  49.76 
 
 
208 aa  208  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  52.76 
 
 
208 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  52.76 
 
 
208 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  52.24 
 
 
206 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  49.76 
 
 
208 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  52.02 
 
 
210 aa  206  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  49.26 
 
 
209 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  52.26 
 
 
208 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  51.26 
 
 
221 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  51.76 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  49.75 
 
 
221 aa  197  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  47.74 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  50 
 
 
212 aa  194  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  51.27 
 
 
216 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  48.29 
 
 
207 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  51.78 
 
 
203 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  49.02 
 
 
205 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  51.34 
 
 
202 aa  181  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  60.9 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  44.66 
 
 
202 aa  170  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  42.5 
 
 
208 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  55.81 
 
 
200 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  41.21 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  41.84 
 
 
201 aa  141  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  41.21 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.21 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.1 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.38 
 
 
203 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.1 
 
 
194 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  42.53 
 
 
194 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  36.5 
 
 
203 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  39.38 
 
 
201 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  40.31 
 
 
203 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  53.12 
 
 
212 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  46.21 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  40.33 
 
 
201 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  39.13 
 
 
230 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  39.13 
 
 
230 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  46.53 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  38.19 
 
 
203 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  38.19 
 
 
203 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.05 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  37.68 
 
 
229 aa  128  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  37.56 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  39.32 
 
 
209 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  50.37 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.5 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  44.2 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.75 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  43.48 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.79 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  43.97 
 
 
231 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  40.69 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.97 
 
 
228 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.37 
 
 
203 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  36.16 
 
 
292 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  38.36 
 
 
201 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  39.31 
 
 
202 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.93 
 
 
217 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  39.75 
 
 
203 aa  104  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  38.35 
 
 
211 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  41.67 
 
 
200 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  35.12 
 
 
209 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  42.34 
 
 
221 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  30.39 
 
 
204 aa  101  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.14 
 
 
197 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>