More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4211 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 379 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  54.5 
 
 		 407 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  48.64 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  46.72 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  48.9 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  45.7 
 
 		 390 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  46.26 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  44.74 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  43.55 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  44.86 
 
 		 389 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  47.25 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  47.97 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  43.39 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  45.9 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  43.39 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  42.97 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  42.12 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  43.44 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  43.01 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  43.51 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  43.68 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  42.67 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  40.32 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  40.89 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  43.99 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  39.67 
 
 		 386 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  38.89 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  32.62 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  31.74 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 397 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  34.1 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  32.05 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31.94 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  31.5 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.28 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  29.17 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.89 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 395 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.49 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  28.57 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  27.79 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1908  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>