More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4174 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  61.24 
 
 		 696 aa  839    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  61.97 
 
 		 690 aa  871    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 716 aa  1460    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  35.47 
 
 		 673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  35.53 
 
 		 662 aa  372  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  33.79 
 
 		 706 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 712 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  34.4 
 
 		 696 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  31.7 
 
 		 704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  31.7 
 
 		 704 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.7 
 
 		 704 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 		 703 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 		 703 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  34.35 
 
 		 705 aa  301  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  31.21 
 
 		 705 aa  300  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  30.11 
 
 		 683 aa  286  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  31.4 
 
 		 699 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  30.65 
 
 		 752 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 708 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  30.57 
 
 		 759 aa  257  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 		 714 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.39 
 
 		 737 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.7 
 
 		 737 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 603 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  31.67 
 
 		 659 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  31.11 
 
 		 687 aa  230  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 821 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  32.26 
 
 		 679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 		 685 aa  220  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  30.38 
 
 		 717 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  28.3 
 
 		 711 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  33.4 
 
 		 734 aa  203  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  31.16 
 
 		 700 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  30.13 
 
 		 809 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.11 
 
 		 712 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 		 663 aa  157  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  27.88 
 
 		 695 aa  151  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.6 
 
 		 1107 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  28.34 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  24.75 
 
 		 815 aa  142  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 		 710 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  23.24 
 
 		 819 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 697 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 564 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 671 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  29.97 
 
 		 615 aa  97.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  27.63 
 
 		 612 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  27.65 
 
 		 613 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  26.67 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  30.66 
 
 		 593 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  29.63 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 707 aa  80.5  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  28.82 
 
 		 601 aa  80.5  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  28.62 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 1033 aa  74.7  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.48 
 
 		 610 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  29.06 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 		 753 aa  71.6  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  24.45 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.94 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  23.15 
 
 		 630 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1421 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2914  hypothetical protein  24.19 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  28.84 
 
 		 619 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.77 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  26.15 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  22.28 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.1 
 
 		 689 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  25.09 
 
 		 616 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.79 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  23.38 
 
 		 699 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  26.87 
 
 		 682 aa  64.3  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06122  DNA helicase IV  23.47 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.94 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  25.08 
 
 		 335 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.22 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  22.17 
 
 		 712 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 729 aa  60.8  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.11 
 
 		 748 aa  60.5  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  24.96 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.94 
 
 		 768 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.58 
 
 		 763 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  24.55 
 
 		 708 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.81 
 
 		 755 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.26 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 697 aa  58.9  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.37 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.2 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  21.53 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.46 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.31 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.75 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>