38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4163 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  83.77 
 
 
191 aa  328  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  83.77 
 
 
191 aa  328  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  65.45 
 
 
191 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  57.84 
 
 
190 aa  214  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  57.46 
 
 
189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  56.73 
 
 
171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  55.61 
 
 
190 aa  207  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  54.4 
 
 
189 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  53.97 
 
 
190 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  46.77 
 
 
189 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  52.66 
 
 
188 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  48.59 
 
 
191 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  44.68 
 
 
191 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  45.3 
 
 
194 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  41.94 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  52.94 
 
 
143 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  35.94 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  35.98 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  35.94 
 
 
196 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  39.87 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  37.04 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  37.21 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  38.81 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  38.16 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  38.06 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  38.64 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  35.81 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  32.54 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  36.88 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  34.53 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  32.33 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  34.04 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  32.81 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  38.18 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  27.93 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  27.33 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  46 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>