50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4162 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  76.77 
 
 		 155 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  76.28 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  76.28 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  60.53 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  61.64 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  61.64 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  59.35 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  54.55 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  71.13 
 
 		 97 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  49.35 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  50.34 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  47.22 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  42.14 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  49.51 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  45.19 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  40.95 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  39.53 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  40.57 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  36.94 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  35.14 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  38.61 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  36.3 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  39.84 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  42.37 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  39.8 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  37.04 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  42.27 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  40.96 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  36.56 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  40.26 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  36.36 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  34.41 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  31.13 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  47.27 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  36.59 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  34.57 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  48.98 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 64 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  39.58 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1962  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0383954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  37.29 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>