58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4143 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  60.77 
 
 		 860 aa  954    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  58.4 
 
 		 873 aa  842    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  58.01 
 
 		 954 aa  643    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  62.86 
 
 		 918 aa  828    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  50.95 
 
 		 889 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  52.85 
 
 		 790 aa  695    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  54.42 
 
 		 768 aa  708    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  54.84 
 
 		 770 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  60.15 
 
 		 1196 aa  1282    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  76.58 
 
 		 7434 aa  5543    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  51.9 
 
 		 777 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  92.47 
 
 		 4830 aa  6268    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  60.98 
 
 		 768 aa  836    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  54.03 
 
 		 764 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  61.22 
 
 		 819 aa  830    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  53.29 
 
 		 763 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  40.92 
 
 		 5442 aa  1387    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  100 
 
 		 3864 aa  7577    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  62.59 
 
 		 781 aa  829    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  38.65 
 
 		 3066 aa  1085    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.72 
 
 		 2156 aa  1265    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  59.49 
 
 		 756 aa  801    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  63.58 
 
 		 465 aa  530  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  61.95 
 
 		 479 aa  527  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.11 
 
 		 4480 aa  400  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  45.87 
 
 		 846 aa  371  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  37.04 
 
 		 1699 aa  335  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  25.32 
 
 		 4697 aa  315  7.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 4678 aa  314  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  50.14 
 
 		 3340 aa  289  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  47.11 
 
 		 4428 aa  279  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  46.67 
 
 		 2796 aa  273  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50.81 
 
 		 1641 aa  270  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.58 
 
 		 2886 aa  252  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  77.4 
 
 		 145 aa  239  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1526 aa  223  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  38.11 
 
 		 2768 aa  205  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  47.53 
 
 		 1099 aa  173  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  43.1 
 
 		 308 aa  159  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.5 
 
 		 2927 aa  133  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 		 2194 aa  125  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 		 1359 aa  108  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1902 aa  107  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  25.35 
 
 		 3227 aa  105  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.88 
 
 		 2839 aa  101  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.56 
 
 		 852 aa  80.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  38.38 
 
 		 1151 aa  78.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  47 
 
 		 2193 aa  73.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  33.86 
 
 		 1092 aa  68.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  42.2 
 
 		 1827 aa  66.6  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  22.83 
 
 		 3470 aa  66.6  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.69 
 
 		 1627 aa  63.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  25.68 
 
 		 3146 aa  58.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2233 aa  58.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  36.36 
 
 		 1586 aa  57.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  26.2 
 
 		 2802 aa  53.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  25 
 
 		 2503 aa  48.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  25.88 
 
 		 3516 aa  47  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>