49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4139 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  83.71 
 
 		 1196 aa  708    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  57.14 
 
 		 756 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  52.24 
 
 		 781 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  54.28 
 
 		 3864 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  100 
 
 		 764 aa  1522    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  86.43 
 
 		 918 aa  731    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  57.57 
 
 		 889 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  74.94 
 
 		 768 aa  1096    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  69.32 
 
 		 770 aa  986    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  61.33 
 
 		 777 aa  874    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  53.66 
 
 		 4830 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  55.01 
 
 		 768 aa  724    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  59.44 
 
 		 763 aa  777    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  67.1 
 
 		 790 aa  932    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  54.62 
 
 		 860 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  55.6 
 
 		 873 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  49.32 
 
 		 7434 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  49.57 
 
 		 819 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  57.5 
 
 		 846 aa  565  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  68.17 
 
 		 465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  53.49 
 
 		 954 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  74.88 
 
 		 479 aa  296  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  47.25 
 
 		 4428 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  49.4 
 
 		 3340 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  48.83 
 
 		 2796 aa  266  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  53.58 
 
 		 308 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  87.59 
 
 		 145 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  51.06 
 
 		 1641 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  46.67 
 
 		 1099 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  34.52 
 
 		 3066 aa  168  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.84 
 
 		 2156 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1526 aa  141  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.14 
 
 		 2768 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.98 
 
 		 5442 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  32.36 
 
 		 4697 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.63 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2839 aa  62  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  30.24 
 
 		 1359 aa  61.6  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  34.3 
 
 		 1699 aa  58.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.81 
 
 		 2927 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1902 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  37.5 
 
 		 2193 aa  51.2  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.64 
 
 		 3227 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 2886 aa  48.5  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.88 
 
 		 1827 aa  48.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 2194 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1321 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1151 aa  45.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.35 
 
 		 746 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>