More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4082 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  100 
 
 		 170 aa  346  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  76.79 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  76.79 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  73.65 
 
 		 169 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  71.08 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  71.78 
 
 		 173 aa  243  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  70.55 
 
 		 173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  69.57 
 
 		 173 aa  238  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  68.29 
 
 		 171 aa  232  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  65.03 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  64.42 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  64.42 
 
 		 167 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  64.42 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  220  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  62.5 
 
 		 167 aa  220  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  63.8 
 
 		 216 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  63.8 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  63.41 
 
 		 169 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0833  peptide deformylase  66.67 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  65.27 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  63.8 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  62.5 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  62.5 
 
 		 167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  63.19 
 
 		 167 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  63.19 
 
 		 181 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  61.21 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  61.21 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  63.64 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  59.76 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  60.49 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  61.11 
 
 		 168 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  58.54 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  61.35 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  57.58 
 
 		 172 aa  196  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  60.13 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  55.69 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  56.89 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  56.89 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  56.63 
 
 		 168 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  58.9 
 
 		 169 aa  191  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  52.76 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  57.67 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  56.02 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  57.49 
 
 		 167 aa  188  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  58.82 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  54.32 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  55.09 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  54.49 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  54.76 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  55.49 
 
 		 168 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  55.49 
 
 		 168 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  55.49 
 
 		 168 aa  184  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  53.01 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  56.71 
 
 		 191 aa  184  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  54.6 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  52.98 
 
 		 170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  53.89 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  53.66 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  57.41 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0024  peptide deformylase  53.37 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  51.2 
 
 		 169 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  52.15 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  53.7 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  53.7 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  53.7 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  53.7 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  52.69 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  52.69 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  59.15 
 
 		 178 aa  180  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  54.82 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  55.36 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  55.83 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  54.76 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  53.29 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  50 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  54.88 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  53.99 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  52.76 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  54.44 
 
 		 184 aa  176  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  54.76 
 
 		 169 aa  176  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  54.17 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  54.17 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  51.53 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04055  peptide deformylase  60 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  52.15 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  54.17 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  53.01 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  53.57 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  53.61 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  52.41 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  52.76 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  52.98 
 
 		 169 aa  174  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  53.05 
 
 		 170 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  52.98 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  52.98 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>