106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4079 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  70.27 
 
 		 111 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  70.27 
 
 		 111 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  58.56 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  63.06 
 
 		 111 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  57.28 
 
 		 111 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  58.88 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  73.42 
 
 		 382 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  51.43 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  96.43 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  87.3 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  98.18 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  80.6 
 
 		 373 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  96.3 
 
 		 220 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  98.15 
 
 		 114 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  80.88 
 
 		 2200 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  62.39 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  96.3 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  92.86 
 
 		 766 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.23 
 
 		 312 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  91.23 
 
 		 101 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  94.55 
 
 		 1083 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  96.36 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  94.44 
 
 		 387 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  92.73 
 
 		 814 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  96.36 
 
 		 100 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  92.86 
 
 		 95 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  51.46 
 
 		 117 aa  104  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  89.47 
 
 		 281 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  65.69 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  73.68 
 
 		 383 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  77.14 
 
 		 634 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  59.57 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  92.73 
 
 		 952 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  80.3 
 
 		 721 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  98 
 
 		 382 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  63.16 
 
 		 383 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  91.07 
 
 		 260 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  77.46 
 
 		 75 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  92.73 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  94.44 
 
 		 256 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  92.73 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  94.55 
 
 		 94 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  94.34 
 
 		 439 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  86.21 
 
 		 940 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  92.59 
 
 		 311 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  96.23 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  94.44 
 
 		 80 aa  99  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  58.49 
 
 		 110 aa  97.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  90.74 
 
 		 202 aa  97.1  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  90.74 
 
 		 270 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  90.57 
 
 		 297 aa  96.3  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  75.38 
 
 		 358 aa  95.5  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  90.57 
 
 		 113 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  79.03 
 
 		 93 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  87.27 
 
 		 120 aa  94.4  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  87.27 
 
 		 106 aa  93.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  90.2 
 
 		 82 aa  90.5  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  83.64 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.07 
 
 		 833 aa  73.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.08 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  35.05 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  63.83 
 
 		 368 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1733  hypothetical protein  78.12 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  61.7 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  61.7 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  37.23 
 
 		 107 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3087  hypothetical protein  96 
 
 		 123 aa  51.2  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.678329  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2411  hypothetical protein  85.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 		 108 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  40.23 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3217  hypothetical protein  82.76 
 
 		 79 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  38.89 
 
 		 108 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  37.76 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  35.92 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  35.92 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  91.67 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4140  hypothetical protein  88.46 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  35.92 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  48.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  35.19 
 
 		 107 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  34.65 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 107 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1348  hypothetical protein  65.62 
 
 		 101 aa  47.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1973  hypothetical protein  91.67 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  37.37 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  37.37 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2403  hypothetical protein  91.3 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>