More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4012 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4012  inner-membrane translocator  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00312938  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
289 aa  131  1e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  33.91 
 
 
295 aa  131  1e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
295 aa  130  2e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  29.58 
 
 
294 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  31.42 
 
 
291 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  34.51 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  31.54 
 
 
291 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  30.63 
 
 
290 aa  120  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  29.93 
 
 
290 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  31.69 
 
 
292 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4104  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
290 aa  118  1e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  32.39 
 
 
293 aa  115  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.8 
 
 
291 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  32.16 
 
 
291 aa  114  1e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5602  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
292 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  28.87 
 
 
290 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  28.97 
 
 
294 aa  113  4e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
291 aa  112  7e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  32.07 
 
 
289 aa  112  8e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  31.6 
 
 
295 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  31.08 
 
 
289 aa  110  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  29.97 
 
 
296 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  9.68352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
289 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
291 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  33.81 
 
 
317 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  31.21 
 
 
300 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  29.43 
 
 
277 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  28.52 
 
 
302 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
293 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  30.36 
 
 
308 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
290 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  29.33 
 
 
290 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  35.21 
 
 
296 aa  102  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
291 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
308 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
319 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
319 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  29.69 
 
 
299 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.84 
 
 
319 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
291 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
304 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
308 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.03 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  26.46 
 
 
292 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
308 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  28.97 
 
 
295 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
308 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.03 
 
 
308 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  29.43 
 
 
294 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.80808e-14 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  30.41 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  31.71 
 
 
291 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  29.23 
 
 
294 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  29.9 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  27.89 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  28.52 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  31.16 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.22442e-08  unclonable  5.14338e-08 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  28.9 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5339  inner-membrane translocator  30.21 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  28.9 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6117  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.34 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  27.49 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.49 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  26.76 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  31.16 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  30.22 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  27.69 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1769  inner-membrane translocator  29.79 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1698  inner-membrane translocator  29.79 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0299512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  28.04 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4852  inner-membrane translocator  30.9 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  26.91 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  27.57 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  27.57 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  29.31 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  31.07 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  27.36 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  27.12 
 
 
291 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
292 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  28.62 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  31.79 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  26.43 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.3 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  28.12 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  26.97 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  29.33 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.62 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.29 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1967  inner-membrane translocator  30.9 
 
 
289 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207347  normal  0.0517862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
294 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  28.17 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.82 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  29.35 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  27.62 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>