More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4011 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4011  inner-membrane translocator  100 
 
 
342 aa  663  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177528  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
317 aa  174  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.52 
 
 
606 aa  174  2e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
348 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  38.11 
 
 
832 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  35.13 
 
 
350 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  36.18 
 
 
593 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  34.81 
 
 
350 aa  169  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.52 
 
 
593 aa  167  3e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.49 
 
 
350 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
337 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.7 
 
 
646 aa  162  5e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  37.85 
 
 
646 aa  163  5e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.9 
 
 
325 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  38.66 
 
 
346 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  37 
 
 
360 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
345 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
349 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.43 
 
 
328 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
326 aa  156  5e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.33 
 
 
830 aa  156  5e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
324 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  37.63 
 
 
663 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  35.53 
 
 
328 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  34.03 
 
 
319 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  39 
 
 
328 aa  154  3e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
310 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.92686e-06  unclonable  5.58621e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  37.4 
 
 
643 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  37.55 
 
 
345 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  35.41 
 
 
332 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  38.27 
 
 
355 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  37.15 
 
 
647 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  36.98 
 
 
648 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.95 
 
 
562 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
300 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 
339 aa  147  2e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  37.4 
 
 
381 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  36.22 
 
 
643 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
339 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0891  inner-membrane translocator  36.28 
 
 
320 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
345 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  36.44 
 
 
336 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  36.74 
 
 
679 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
314 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
340 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
345 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  34.04 
 
 
319 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.76 
 
 
418 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  37.36 
 
 
678 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  33.74 
 
 
401 aa  141  1e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  2.17655e-08 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2112  inner-membrane translocator  33.86 
 
 
376 aa  141  2e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  37.83 
 
 
652 aa  140  2e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
330 aa  141  2e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
341 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
321 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  34.78 
 
 
293 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  37.83 
 
 
652 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  36.03 
 
 
349 aa  140  4e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
321 aa  139  5e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.07 
 
 
332 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.65 
 
 
424 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
327 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  35.41 
 
 
433 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
407 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  36.17 
 
 
612 aa  137  3e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.16 
 
 
418 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  37.69 
 
 
652 aa  137  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
354 aa  137  3e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
335 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
358 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
327 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
309 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
357 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1741  inner-membrane translocator  31.77 
 
 
336 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  35.69 
 
 
828 aa  135  7e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  32.44 
 
 
443 aa  135  7e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  33.2 
 
 
373 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
298 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
421 aa  135  1e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.41 
 
 
423 aa  135  1e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
315 aa  134  2e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.75 
 
 
418 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  34.59 
 
 
415 aa  134  2e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.75 
 
 
418 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
357 aa  134  2e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  33.58 
 
 
299 aa  134  2e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  37.98 
 
 
358 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.11 
 
 
421 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
357 aa  133  4e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.75 
 
 
418 aa  133  4e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  33.96 
 
 
352 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
370 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  33.97 
 
 
333 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.2 
 
 
412 aa  132  7e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.55 
 
 
389 aa  132  7e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  35.98 
 
 
352 aa  132  7e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
314 aa  132  8e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.01 
 
 
418 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3859  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.22 
 
 
425 aa  132  1e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.107872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.29 
 
 
423 aa  131  1e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>