More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3996 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  66.29 
 
 		 978 aa  1312    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  53.69 
 
 		 958 aa  1042    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.27 
 
 		 928 aa  836    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  65.62 
 
 		 953 aa  1297    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  66.29 
 
 		 978 aa  1314    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  67.71 
 
 		 978 aa  1339    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  63.89 
 
 		 969 aa  1291    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  47.87 
 
 		 932 aa  868    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  66.77 
 
 		 978 aa  1333    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  67.99 
 
 		 974 aa  1354    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.59 
 
 		 974 aa  1022    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  87.87 
 
 		 981 aa  1828    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.81 
 
 		 935 aa  918    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  61.48 
 
 		 961 aa  1242    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  68.34 
 
 		 978 aa  1348    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  66.18 
 
 		 973 aa  1311    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 979 aa  2026    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  54.06 
 
 		 968 aa  1060    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.46 
 
 		 973 aa  977    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  83.84 
 
 		 981 aa  1728    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  66.29 
 
 		 973 aa  1313    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  68.3 
 
 		 974 aa  1359    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  66.25 
 
 		 973 aa  1315    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  66.29 
 
 		 973 aa  1313    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  66.29 
 
 		 973 aa  1313    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.03 
 
 		 923 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.41 
 
 		 858 aa  204  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 		 928 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  25.92 
 
 		 930 aa  193  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.81 
 
 		 927 aa  183  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 		 932 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  24.72 
 
 		 917 aa  181  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  23.17 
 
 		 992 aa  180  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  26.44 
 
 		 909 aa  177  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.6 
 
 		 910 aa  175  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 812 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 		 817 aa  170  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 		 1155 aa  168  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.81 
 
 		 1148 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  32.44 
 
 		 1426 aa  163  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 		 807 aa  164  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 		 856 aa  164  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 		 837 aa  160  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  27.68 
 
 		 803 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  32.44 
 
 		 1434 aa  160  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.28 
 
 		 911 aa  152  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 		 803 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  24.61 
 
 		 820 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.21 
 
 		 864 aa  148  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  23.16 
 
 		 851 aa  149  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  23.98 
 
 		 938 aa  146  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 		 800 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 		 781 aa  145  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.88 
 
 		 839 aa  144  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 		 916 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  22.01 
 
 		 934 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  24.9 
 
 		 1029 aa  143  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  24.92 
 
 		 909 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  23.51 
 
 		 826 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.97 
 
 		 814 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  24.49 
 
 		 876 aa  142  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.9 
 
 		 814 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.63 
 
 		 814 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 805 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.9 
 
 		 814 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.8 
 
 		 814 aa  141  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.68 
 
 		 814 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.34 
 
 		 1138 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.86 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.68 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 		 765 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.91 
 
 		 1018 aa  139  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  31.15 
 
 		 800 aa  138  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.31 
 
 		 806 aa  137  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 805 aa  137  9e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.69 
 
 		 811 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.72 
 
 		 811 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.81 
 
 		 811 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.81 
 
 		 811 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.82 
 
 		 811 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.03 
 
 		 898 aa  132  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.04 
 
 		 798 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.17 
 
 		 826 aa  130  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.1 
 
 		 798 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  24.1 
 
 		 807 aa  129  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.1 
 
 		 807 aa  129  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.1 
 
 		 807 aa  129  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  24.1 
 
 		 807 aa  129  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  22.02 
 
 		 856 aa  128  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.65 
 
 		 817 aa  128  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  31.23 
 
 		 722 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.99 
 
 		 807 aa  127  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 		 913 aa  127  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.34 
 
 		 836 aa  127  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>