More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3987 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  88.49 
 
 
339 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  86.93 
 
 
349 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  70.43 
 
 
333 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  69.43 
 
 
314 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  57.14 
 
 
337 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  56 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  50.33 
 
 
322 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.22 
 
 
331 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  44.74 
 
 
332 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  46.73 
 
 
339 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  44.85 
 
 
327 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  47.06 
 
 
371 aa  292  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  47.85 
 
 
330 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  47.85 
 
 
330 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  48.12 
 
 
333 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  47.54 
 
 
325 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  45.54 
 
 
333 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.36 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.67 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.67 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  44.52 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.73 
 
 
328 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.48 
 
 
339 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  44.52 
 
 
328 aa  272  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  48.46 
 
 
353 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.63 
 
 
324 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.16 
 
 
330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 
331 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.14 
 
 
327 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  48.83 
 
 
331 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.5 
 
 
325 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.86 
 
 
333 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.88 
 
 
328 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  44.58 
 
 
342 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.04 
 
 
335 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.95 
 
 
328 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.95 
 
 
328 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.26 
 
 
325 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.95 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.95 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 
314 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  46.15 
 
 
326 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.3 
 
 
322 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.07 
 
 
320 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.43 
 
 
326 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  43.56 
 
 
343 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.8 
 
 
333 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.54 
 
 
333 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  41.72 
 
 
336 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.32 
 
 
322 aa  256  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.06 
 
 
335 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.14 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.39 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.95 
 
 
325 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  41.03 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.87 
 
 
327 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.34 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3258  hypothetical protein  44.3 
 
 
327 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0738365  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.3 
 
 
328 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.49 
 
 
332 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.96 
 
 
330 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.34 
 
 
332 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.67 
 
 
335 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  42.07 
 
 
325 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.1 
 
 
339 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.94 
 
 
334 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.39 
 
 
339 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.34 
 
 
356 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.61 
 
 
332 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.97 
 
 
321 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.69 
 
 
328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  41.58 
 
 
327 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.72 
 
 
332 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.48 
 
 
323 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.94 
 
 
336 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.19 
 
 
325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.63 
 
 
344 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.71 
 
 
326 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.72 
 
 
332 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.19 
 
 
322 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  42.07 
 
 
323 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.19 
 
 
329 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.51 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  43.14 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.12 
 
 
330 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.72 
 
 
325 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  44.11 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.51 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  45.82 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.98 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  41.61 
 
 
362 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 
322 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>