More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3841 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  71.75 
 
 
270 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 
275 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  73.03 
 
 
270 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  57.41 
 
 
270 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  62.16 
 
 
272 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 
268 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.29 
 
 
281 aa  255  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.72 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
257 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
282 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.24 
 
 
275 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 
276 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 
281 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 
281 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.45 
 
 
275 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  41.99 
 
 
296 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
313 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  39.5 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
257 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.67 
 
 
262 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.03 
 
 
297 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.05 
 
 
274 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
271 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
271 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
264 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
263 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  36.06 
 
 
294 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
271 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
309 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
299 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
274 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
260 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 
260 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 
291 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
269 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  38.16 
 
 
295 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
260 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  40.28 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.81 
 
 
263 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  36.49 
 
 
301 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
263 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
288 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
307 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
255 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
266 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
290 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.79 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
263 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
298 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.56 
 
 
263 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
280 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
289 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.32 
 
 
260 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
273 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  38.24 
 
 
262 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
274 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
260 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
265 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  37.87 
 
 
262 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.39 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.5 
 
 
259 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
258 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 
274 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
267 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  38.01 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  31.99 
 
 
267 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
262 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
256 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>