More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3574 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  582  1e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
292 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.21 
 
 
302 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  61.07 
 
 
349 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.07 
 
 
349 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.65 
 
 
293 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.04 
 
 
317 aa  354  8e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.34 
 
 
317 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.34 
 
 
317 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.04 
 
 
317 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  54.96 
 
 
302 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.61 
 
 
302 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  55.44 
 
 
310 aa  327  1e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  55.44 
 
 
310 aa  327  1e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 
309 aa  326  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
293 aa  326  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.67 
 
 
302 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.75 
 
 
298 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.84 
 
 
302 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  53.19 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  53.19 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  53.19 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  53.19 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  53.19 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  53.19 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.36 
 
 
302 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
295 aa  321  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.36 
 
 
289 aa  321  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.19 
 
 
292 aa  321  1e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
312 aa  320  2e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.3 
 
 
292 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  50.35 
 
 
299 aa  319  4e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
302 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
302 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
302 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  52.3 
 
 
357 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
312 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.13 
 
 
312 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
312 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.13 
 
 
312 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.68646e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
294 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.13 
 
 
312 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
292 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.42 
 
 
313 aa  311  8e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.46 
 
 
309 aa  308  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
290 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.97 
 
 
319 aa  283  2e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.97 
 
 
319 aa  283  2e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.61 
 
 
309 aa  282  5e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
301 aa  244  1e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
301 aa  244  1e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.75 
 
 
300 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
304 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
302 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  42.7 
 
 
290 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
305 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
295 aa  234  1e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
295 aa  234  2e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
298 aa  233  4e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
295 aa  233  4e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
314 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
318 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
302 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.38 
 
 
313 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
335 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
330 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
330 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
323 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
306 aa  198  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
307 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  36.14 
 
 
295 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
323 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
302 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
298 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.48 
 
 
300 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
333 aa  162  5e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
299 aa  153  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
298 aa  151  9e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.58297e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
290 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
299 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
291 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
329 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
313 aa  141  1e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
321 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
298 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
319 aa  133  4e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
319 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172357  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
328 aa  132  7e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.31 
 
 
318 aa  130  2e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
305 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
317 aa  128  1e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.07 
 
 
302 aa  128  1e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
307 aa  128  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 
307 aa  128  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
309 aa  127  2e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
325 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
348 aa  126  4e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
310 aa  126  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
308 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>