More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3365 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  60.51 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  60 
 
 		 210 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  60 
 
 		 213 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.85 
 
 		 210 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  57.35 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  55 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  58.25 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.43 
 
 		 288 aa  227  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.43 
 
 		 210 aa  227  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.07 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  55.88 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.34 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  55.39 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  54.81 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  55.34 
 
 		 215 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  54.37 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  54.85 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  54.85 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  54.41 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  54.37 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  56.5 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.37 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.12 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0366  RhtB family transporter  59.5 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  56.25 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.35 
 
 		 210 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  54.82 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  56.77 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  51.96 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.5 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.84 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.94 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4244  lysine exporter protein LysE/YggA  50.51 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  49.52 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.02 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5788  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.51444  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6153  lysine exporter protein LysE/YggA  45.05 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757704  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  44.06 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6633  lysine exporter protein LysE/YggA  44.06 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.76 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0739  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.63 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7707  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.83 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  42.93 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  42.57 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  40.91 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  40.91 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.83 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  41.85 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  42.27 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.92 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.3 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.73 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.15 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.08 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37.99 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.17 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.72 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  37.78 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  38.92 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  37.84 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  33.5 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  33.7 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.15 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  33.15 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.15 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  33.15 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  33.15 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  33.15 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  33.15 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.33 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.21 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  33.15 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.22 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  33.33 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3130  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.77 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.5 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>