101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3350 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  100 
 
 
103 aa  207  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  92.31 
 
 
104 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  67 
 
 
100 aa  148  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  64.58 
 
 
104 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  63.54 
 
 
106 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  63.54 
 
 
107 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  62.5 
 
 
106 aa  130  7e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  52.56 
 
 
99 aa  81.6  4e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3002  addiction module antidote protein  47.25 
 
 
112 aa  80.9  6e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3123  putative transcriptional regulator  43.16 
 
 
103 aa  79  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2079  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
100 aa  77  8e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5375  hypothetical protein  38.71 
 
 
114 aa  73.9  6e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00339875  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 
109 aa  73.2  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  45 
 
 
109 aa  72.8  1e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 
109 aa  73.2  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  45 
 
 
109 aa  73.2  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 
109 aa  72.8  2e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3155  putative transcriptional regulator  50.63 
 
 
99 aa  71.2  5e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239561  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2621  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 
150 aa  70.1  9e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 
96 aa  69.7  1e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  40.22 
 
 
116 aa  66.6  1e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0368  addiction module antidote protein  50 
 
 
100 aa  66.2  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0898  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
96 aa  63.9  8e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  3.68951e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0829  hypothetical protein  41.86 
 
 
98 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00761962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0856  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 
98 aa  61.2  5e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.623315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 
239 aa  59.7  1e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3926  putative transcriptional regulator  40 
 
 
105 aa  59.7  1e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.511666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0494  hypothetical protein  57.14 
 
 
63 aa  58.9  2e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4548  putative transcriptional regulator  40 
 
 
100 aa  58.9  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
97 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
95 aa  57.8  5e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1686  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 
98 aa  57  7e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9109  hypothetical protein  46.48 
 
 
286 aa  57  8e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1150  hypothetical protein  37.65 
 
 
133 aa  56.6  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2007  transcriptional regulator  34.88 
 
 
102 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1295  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 
121 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.053916  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6313  addiction module antidote protein  39.73 
 
 
97 aa  55.5  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0276744  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6535  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 
121 aa  55.8  2e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 
107 aa  55.8  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0861  transcriptional regulator  39.47 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6941  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 
99 aa  55.5  3e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2993  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 
92 aa  55.1  3e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  39.39 
 
 
95 aa  54.3  5e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0573  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 
101 aa  54.3  6e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2207  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 
102 aa  54.3  6e-07  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0184  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 
94 aa  53.9  7e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.57004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0366  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 
104 aa  53.9  8e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0174  putative addiction module antidote protein  34.15 
 
 
95 aa  52.8  2e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0040  addiction module antidote protein  37.33 
 
 
95 aa  51.6  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  43.02 
 
 
95 aa  52  3e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  32.98 
 
 
106 aa  52  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4952  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 
99 aa  51.2  4e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0141  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
99 aa  51.2  4e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389686  hitchhiker  0.00339535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3989  hypothetical protein  34.15 
 
 
95 aa  51.2  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3348  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 
40 aa  51.6  4e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767787  normal  0.423432 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3881  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 
131 aa  51.2  5e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.26577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 
107 aa  51.2  5e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0449  hypothetical protein  36.36 
 
 
98 aa  51.2  5e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0146  addiction module antidote protein  42.65 
 
 
118 aa  50.8  6e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1813  hypothetical protein  42.65 
 
 
118 aa  50.8  6e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2280  transcriptional regulator-like  39.44 
 
 
305 aa  50.4  8e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  0.372156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  36.47 
 
 
98 aa  49.7  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 
98 aa  49.7  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1303  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 
96 aa  50.1  1e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
97 aa  48.5  3e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1488  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 
87 aa  48.9  3e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.3464  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1426  addiction module antidote protein  32.86 
 
 
92 aa  48.5  3e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00137891  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1201  addiction module antidote protein  32.86 
 
 
92 aa  48.5  3e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  2.59095e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 
98 aa  48.5  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3743  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.643331 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3780  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.798445  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4018  putative transcriptional regulator  45 
 
 
106 aa  48.1  4e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3672  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.932392  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0051  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 
92 aa  48.1  4e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05545  hypothetical protein  34.69 
 
 
99 aa  47.8  5e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2314  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 
99 aa  48.1  5e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0420  transcriptional regulator  38.89 
 
 
95 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.461361  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5507  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 
99 aa  47.8  6e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366583  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1443  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 
97 aa  47.4  7e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40590  transcriptional regulator protein  36.26 
 
 
102 aa  47  8e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1983  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4583  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0606  addiction module antidote protein  32.43 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0500  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1725  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1332  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.043655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1631  hypothetical protein  35.23 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  31.17 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2824  addiction module antidote protein  30.67 
 
 
101 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96791  normal  0.589789 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  31.91 
 
 
139 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0569  Cro/CI family transcriptional regulator  32.95 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0237  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  29.55 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  33.33 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1358  putative DNA-binding prophage protein  43.59 
 
 
46 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.190658  hitchhiker  0.000534909 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1254  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>