86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3349 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3349  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  233  5e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000920139  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4221  hypothetical protein  94.55 
 
 
107 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2958  hypothetical protein  66.07 
 
 
116 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1183  hypothetical protein  65.18 
 
 
113 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18062  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4138  hypothetical protein  65.18 
 
 
113 aa  140  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0172764  normal  0.111049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36110  hypothetical protein  61.61 
 
 
111 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0277  putative addiction module killer protein  52.29 
 
 
107 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3001  addiction module killer protein  50.91 
 
 
107 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2241  addiction module killer protein  50 
 
 
111 aa  113  1e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0016  probable addiction module killer protein  48.18 
 
 
111 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0172  addiction module killer protein  51.46 
 
 
121 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  47.66 
 
 
114 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5334  hypothetical protein  45.45 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3503  addiction module killer protein  45.45 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149451  hitchhiker  0.00969032 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  44.64 
 
 
110 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  44.64 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3921  addiction module killer protein  44.55 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0367  addiction module killer protein  46.73 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.247793 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  51.11 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  47.37 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  47.13 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  42.72 
 
 
107 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2008  hypothetical protein  46.24 
 
 
97 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  47.78 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  48.91 
 
 
96 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  4.74289e-05 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  48.94 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2208  addiction module killer protein  47.62 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.63367  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  48.91 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0450  hypothetical protein  47.37 
 
 
98 aa  83.2  1e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  47.73 
 
 
96 aa  82.8  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3081  hypothetical protein  45.92 
 
 
98 aa  81.6  3e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2671  hypothetical protein  44.21 
 
 
99 aa  81.6  3e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0041  addiction module killer protein  50 
 
 
105 aa  81.3  4e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  41.9 
 
 
108 aa  80.9  6e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0569  addiction module killer protein  51.14 
 
 
96 aa  80.5  8e-15  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.443198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4549  addiction module killer protein  48.91 
 
 
123 aa  80.1  9e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0607  addiction module killer protein  46.99 
 
 
95 aa  79.7  1e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  44.33 
 
 
101 aa  80.1  1e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0570  addiction module killer protein  50 
 
 
99 aa  79.3  2e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  1.32448e-12  unclonable  2.98787e-21 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3175  addiction module killer protein  49.4 
 
 
100 aa  79  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2313  hypothetical protein  50.59 
 
 
112 aa  79  2e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  43.16 
 
 
100 aa  78.6  2e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0236  addiction module killer protein  48.19 
 
 
95 aa  79.3  2e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  48.35 
 
 
102 aa  78.6  3e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  7.89076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  77.8  4e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  51.16 
 
 
96 aa  77.4  6e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0501  hypothetical protein  49.41 
 
 
115 aa  77.4  7e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8269  addiction module killer protein  45.26 
 
 
101 aa  77  8e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3742  addiction module killer protein  49.41 
 
 
112 aa  76.3  1e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4582  hypothetical protein  49.41 
 
 
112 aa  76.3  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.213587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3781  hypothetical protein  49.41 
 
 
112 aa  76.3  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.519742  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1302  addiction module killer protein  43.75 
 
 
112 aa  75.9  2e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3266  addiction module killer protein  44.21 
 
 
100 aa  75.1  3e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  39.05 
 
 
108 aa  75.1  3e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  46.15 
 
 
99 aa  74.3  5e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4017  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  73.2  1e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5508  hypothetical protein  48.24 
 
 
109 aa  73.2  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1814  hypothetical protein  44.58 
 
 
104 aa  72.8  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2739  hypothetical protein  44.58 
 
 
104 aa  72.8  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0457  hypothetical protein  41.38 
 
 
98 aa  72.4  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0568  hypothetical protein  58.82 
 
 
86 aa  72.4  2e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2689  hypothetical protein  44.58 
 
 
98 aa  72.4  2e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3673  addiction module killer protein  47.06 
 
 
105 aa  72  3e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0050  addiction module killer protein  37.36 
 
 
108 aa  70.5  8e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0225  hypothetical protein  38.95 
 
 
105 aa  70.5  8e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  38.1 
 
 
108 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3745  addiction module killer protein  42.39 
 
 
101 aa  69.7  1e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117851  hitchhiker  0.00174099 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  44.09 
 
 
102 aa  69.7  1e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4951  addiction module killer protein  45.78 
 
 
105 aa  70.1  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0855  addiction module killer protein  46.59 
 
 
97 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503668  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_003296  RS05544  hypothetical protein  51.35 
 
 
75 aa  68.9  2e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  40 
 
 
108 aa  68.2  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  38.24 
 
 
106 aa  68.2  4e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2734  addiction module killer protein  37.61 
 
 
112 aa  67.8  5e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1307  hypothetical protein  33.01 
 
 
115 aa  66.2  1e-10  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000276635  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6312  addiction module killer protein  42.42 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0289736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3915  hypothetical protein  36.54 
 
 
111 aa  64.7  4e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  47.44 
 
 
99 aa  64.7  4e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4948  addiction module killer protein  41.35 
 
 
101 aa  63.2  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583991  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1687  addiction module killer protein  39.08 
 
 
98 aa  62.4  2e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1427  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  58.2  4e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1836  hypothetical protein  35.48 
 
 
115 aa  57.8  5e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.204816  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  53.1  1e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  51.02 
 
 
51 aa  47.8  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1245  addiction module killer protein  33.33 
 
 
119 aa  47.8  6e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1331  addiction module killer protein  56.1 
 
 
48 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0428301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>