63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3203 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  100 
 
 
954 aa  1889    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  71.58 
 
 
4830 aa  731    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  57.86 
 
 
3864 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  54.35 
 
 
860 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  50.51 
 
 
1196 aa  522  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  50.07 
 
 
7434 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  49.52 
 
 
918 aa  483  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  53.11 
 
 
768 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  53.44 
 
 
819 aa  439  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  53.02 
 
 
781 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  57.14 
 
 
763 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  52.3 
 
 
756 aa  409  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  55.97 
 
 
873 aa  389  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  53.38 
 
 
764 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  89.3 
 
 
479 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  88.24 
 
 
768 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  87.44 
 
 
770 aa  339  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  79.9 
 
 
777 aa  333  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  78.43 
 
 
790 aa  331  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  78.33 
 
 
465 aa  327  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  48.19 
 
 
846 aa  323  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  37.85 
 
 
889 aa  309  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  77.4 
 
 
145 aa  235  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  58.59 
 
 
4428 aa  232  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  54.63 
 
 
3340 aa  231  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.22 
 
 
2156 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.99 
 
 
3066 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  60.1 
 
 
1641 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  51.58 
 
 
2796 aa  202  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  51.32 
 
 
1099 aa  171  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.48 
 
 
5442 aa  166  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  34.22 
 
 
1526 aa  160  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.14 
 
 
2768 aa  135  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  33.65 
 
 
4697 aa  126  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  32.62 
 
 
308 aa  104  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 
2886 aa  90.9  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  31.72 
 
 
1699 aa  84.7  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  32.48 
 
 
2194 aa  73.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  37.1 
 
 
1151 aa  69.7  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  32.37 
 
 
1359 aa  67.4  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.47 
 
 
4480 aa  67  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  33.75 
 
 
1827 aa  62  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.48 
 
 
2839 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  28.3 
 
 
3146 aa  59.3  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.88 
 
 
2927 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  35.71 
 
 
2193 aa  55.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  31.96 
 
 
4678 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  42.68 
 
 
1586 aa  52  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  29.65 
 
 
1902 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  49.28 
 
 
537 aa  51.6  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  34.01 
 
 
2233 aa  52  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  38.67 
 
 
382 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  38.67 
 
 
382 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.66 
 
 
792 aa  48.9  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.89 
 
 
2503 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.95 
 
 
1627 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  27.64 
 
 
1321 aa  48.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  23.61 
 
 
3470 aa  48.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  33.08 
 
 
3670 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.17 
 
 
3227 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.25 
 
 
746 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  46.48 
 
 
356 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.25 
 
 
7541 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>