More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3187 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  80.87 
 
 
309 aa  488  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  75.25 
 
 
309 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  70.37 
 
 
306 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  68.69 
 
 
311 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  67.79 
 
 
303 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  69.26 
 
 
306 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  65.76 
 
 
313 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  69.59 
 
 
310 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  69.26 
 
 
306 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  68.24 
 
 
306 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  68.24 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  68.49 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  67.57 
 
 
302 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  66.11 
 
 
303 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  62.54 
 
 
304 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  62.21 
 
 
304 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  61.33 
 
 
307 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  67 
 
 
308 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  55.71 
 
 
307 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  53.87 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  54.51 
 
 
305 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  52.76 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  47.44 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
297 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
314 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0846  LysR family transcriptional regulator  54.06 
 
 
237 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 
347 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 
311 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
308 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
308 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 
304 aa  258  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
326 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 
342 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  48.71 
 
 
428 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
302 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
304 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3701  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
304 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0968  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5033  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.85 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0753  LysR substrate binding domain-containing protein  47.28 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5765  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
555 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
307 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0931  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
360 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
301 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
335 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
313 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
301 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 
318 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0764  LysR substrate binding domain-containing protein  46.86 
 
 
274 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
307 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
307 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
300 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
300 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
300 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 
301 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
300 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
300 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
327 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
341 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0426  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
321 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144523  hitchhiker  0.000318501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0367  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 
321 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0374  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
321 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
301 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
327 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
327 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3397  helix-turn-helix, Fis-type  38.7 
 
 
294 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00341475  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 
304 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
307 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
330 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0365  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
321 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.916337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
307 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5815  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 
318 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.416763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
327 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.61 
 
 
304 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
335 aa  205  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6191  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 
305 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3639  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 
294 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
307 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1630  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
320 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>