More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3128 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  78.76 
 
 
520 aa  858  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  65.6 
 
 
532 aa  727  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  81.57 
 
 
518 aa  880  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  100 
 
 
518 aa  1070  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  67.74 
 
 
538 aa  730  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  62.72 
 
 
525 aa  670  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  62.72 
 
 
525 aa  670  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  64.16 
 
 
511 aa  681  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  81.91 
 
 
517 aa  865  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  59.77 
 
 
517 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  59.61 
 
 
501 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  59.61 
 
 
501 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  58 
 
 
519 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  58.24 
 
 
527 aa  612  1e-174  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  58.13 
 
 
523 aa  613  1e-174  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  57.2 
 
 
528 aa  609  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  57.23 
 
 
519 aa  610  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  59 
 
 
537 aa  607  1e-172  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  55.56 
 
 
540 aa  605  1e-172  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  57.03 
 
 
576 aa  601  1e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  58.74 
 
 
514 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  55.7 
 
 
535 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  57.28 
 
 
515 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  56.42 
 
 
540 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  58.65 
 
 
540 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  56.3 
 
 
498 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  56.27 
 
 
497 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  54.62 
 
 
510 aa  583  1e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  56.31 
 
 
521 aa  581  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  53.32 
 
 
503 aa  563  1e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  53.7 
 
 
529 aa  559  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  52.21 
 
 
544 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  52.57 
 
 
529 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  55.75 
 
 
544 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  55.09 
 
 
527 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  54.26 
 
 
500 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  1.54488e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  50.98 
 
 
570 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  53.59 
 
 
549 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  52.08 
 
 
539 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  48.92 
 
 
567 aa  542  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  52.48 
 
 
564 aa  538  1e-152  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  52.76 
 
 
540 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  51.92 
 
 
544 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  48.65 
 
 
567 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  53.27 
 
 
541 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  48.66 
 
 
569 aa  525  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  53.05 
 
 
548 aa  517  1e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  52.66 
 
 
543 aa  508  1e-142  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  46.63 
 
 
568 aa  500  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  42.83 
 
 
849 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  38.95 
 
 
528 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  39.67 
 
 
510 aa  356  5e-97  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  39.28 
 
 
508 aa  356  7e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.01 
 
 
517 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  39.33 
 
 
533 aa  340  3e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  37.7 
 
 
538 aa  340  3e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  36.7 
 
 
529 aa  322  1e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  39.32 
 
 
495 aa  313  5e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  39.32 
 
 
495 aa  313  5e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  38 
 
 
662 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  34.96 
 
 
495 aa  283  5e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  33.52 
 
 
526 aa  283  5e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  36.62 
 
 
694 aa  283  8e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.85 
 
 
587 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  34.65 
 
 
574 aa  263  5e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  34.44 
 
 
574 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  34.67 
 
 
633 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  34.65 
 
 
574 aa  256  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  31.85 
 
 
772 aa  253  5e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  34.33 
 
 
585 aa  253  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  35.26 
 
 
523 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  35.26 
 
 
508 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  34.08 
 
 
822 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  34.38 
 
 
808 aa  244  2e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.62 
 
 
860 aa  244  2e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  32.53 
 
 
501 aa  244  2e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.31 
 
 
505 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  32.78 
 
 
814 aa  240  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  33.61 
 
 
504 aa  236  5e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  32.98 
 
 
816 aa  235  2e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  32.66 
 
 
709 aa  234  4e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  31.68 
 
 
495 aa  229  6e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  34.36 
 
 
824 aa  230  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  31.2 
 
 
516 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  32.98 
 
 
505 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  32.34 
 
 
498 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  31.07 
 
 
522 aa  226  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  31.59 
 
 
526 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  31.15 
 
 
568 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  31.94 
 
 
815 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  31.98 
 
 
565 aa  223  5e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  30.24 
 
 
527 aa  222  1e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  31.4 
 
 
511 aa  222  2e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  30.15 
 
 
494 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  29.28 
 
 
523 aa  217  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  31.33 
 
 
499 aa  217  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  31.87 
 
 
498 aa  214  4e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  1.57011e-11 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  31.9 
 
 
500 aa  213  8e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  30.75 
 
 
891 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  29.87 
 
 
527 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>