More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3043 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3043  ABC transporter related  100 
 
 		 314 aa  630  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0610173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6511  ABC transporter related  36 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5655  ABC transporter related  38.46 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6020  ABC transporter related  38.46 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.628016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 237 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  31.68 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  33.16 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  32.11 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7429  ABC efflux pump, ATPase subunit  35.46 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0346135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  30.63 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  36.59 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  35.42 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  30.8 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  31.97 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  33.61 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  33.5 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.45 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  35.35 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  33.18 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6132  ABC transporter related  33.21 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  decreased coverage  0.00989011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  34.47 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3152  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0700  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.430015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  31.23 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2894  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1466  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  37.26 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  31.96 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0517  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0535  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  35.45 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2724  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  32.5 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  28.75 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  32.29 
 
 		 583 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  30.94 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  34.23 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.16 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  29.96 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.27 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  33.33 
 
 		 741 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  33.33 
 
 		 912 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  29.9 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  34.1 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  32.65 
 
 		 928 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  31.79 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  32.12 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  34.2 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  34.88 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.73 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  31.53 
 
 		 912 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 		 907 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  31.78 
 
 		 901 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  30.88 
 
 		 901 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  30.84 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  33.16 
 
 		 909 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  30.88 
 
 		 901 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  31.37 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  35.1 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  30.67 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  31.31 
 
 		 912 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  30.89 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  33.18 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  33.18 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  31.73 
 
 		 756 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  31.75 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  26.05 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  35.71 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  29.15 
 
 		 255 aa  92.8  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  30.19 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  32.12 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  31.82 
 
 		 912 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  32.08 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.73 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  33.86 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  30.14 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  29.95 
 
 		 913 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>