More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3020 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  98.35 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  98.35 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  96.69 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  86.78 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  83.47 
 
 		 121 aa  211  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  80.17 
 
 		 121 aa  205  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  79.34 
 
 		 121 aa  205  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  77.5 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  61.16 
 
 		 122 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  62.71 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  61.16 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  57.5 
 
 		 121 aa  147  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  55.37 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  56.67 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  52.99 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  54.24 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  50.85 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  51.75 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  50.85 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  52.59 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  52.59 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  54.29 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  53.7 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  48.57 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  50.47 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  46.79 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  42.37 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.54 
 
 		 300 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 386 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 386 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  39.47 
 
 		 1127 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 231 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.83 
 
 		 229 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 		 382 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  41.74 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 427 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  38.79 
 
 		 232 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 306 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.17 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 245 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.98 
 
 		 245 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  37.93 
 
 		 190 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 241 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  41.88 
 
 		 235 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  38.46 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.79 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>