71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3019 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  100 
 
 		 175 aa  347  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  79.31 
 
 		 175 aa  278  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  79.31 
 
 		 175 aa  277  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  78.74 
 
 		 175 aa  276  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  66.47 
 
 		 175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  61.93 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  60.57 
 
 		 176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  59.09 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  55.68 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  54.02 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  49.71 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  34.48 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  32.95 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  36.52 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  35.26 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  32.37 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  37.65 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  33.15 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  32.96 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  33.33 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  35.48 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  27.71 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  27.11 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  31.65 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  27.34 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  34.4 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  34.4 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  23.43 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  27.2 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.62 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  38.61 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  27.87 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  27.33 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  35.35 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  27.06 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  27.06 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  34.95 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  27.86 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  34.29 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  26.62 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  26.47 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  27.01 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  30.43 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  34.86 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  33.03 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  25.38 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  26.98 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  33.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  31.82 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  33.68 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  26.05 
 
 		 308 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.53 
 
 		 907 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  41.77 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.36 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  41.77 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  35.38 
 
 		 182 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  32.2 
 
 		 779 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  33 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  44 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.32 
 
 		 139 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  27.1 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.78 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001360  chemotaxis protein CheV  23.48 
 
 		 304 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  25 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>