94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3012 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  73.78 
 
 		 340 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  69.21 
 
 		 344 aa  472  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  59.32 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  58.59 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  54.71 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  55.62 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  54.66 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  54.66 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  56.17 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  54.49 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  53.4 
 
 		 351 aa  345  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  54.18 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  53.09 
 
 		 352 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  53.09 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  50.61 
 
 		 332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  51.98 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  52.62 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  52.63 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  52.01 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  52 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  51.23 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  51.21 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  49.08 
 
 		 342 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  50.16 
 
 		 356 aa  311  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  49.09 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  51.72 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  50.78 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  49.68 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  47.87 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  49.04 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  47.88 
 
 		 333 aa  289  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  48.7 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  46.01 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  44.48 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  47.44 
 
 		 366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  45.76 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  45.25 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  47.25 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  43.2 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  45.15 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  45.31 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  50.36 
 
 		 281 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  41.27 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  41.27 
 
 		 345 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  42.6 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  46.08 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  43.45 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  42.99 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  45.34 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  44.37 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.56 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  44 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  42.42 
 
 		 343 aa  248  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  44.16 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  48.93 
 
 		 242 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  45.23 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  53.23 
 
 		 192 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  53.66 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  30.36 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  51.24 
 
 		 197 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  46.4 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  55.86 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  45.97 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  45.97 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  46.03 
 
 		 210 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  44.53 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  48.39 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  50.86 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  39.35 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  40 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  45.3 
 
 		 126 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  36.69 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 141 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  40.5 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  42.28 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  44.44 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  39.06 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  41.23 
 
 		 154 aa  92.8  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  41.38 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  35.29 
 
 		 198 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  36.28 
 
 		 135 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  44.09 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  30.97 
 
 		 121 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  38.37 
 
 		 90 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  39.44 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  43.55 
 
 		 105 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  35.71 
 
 		 108 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  37.36 
 
 		 117 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  36.54 
 
 		 88 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  46.2  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>